RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.28■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.27■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 FBXO41Q8TF61 875 aa37.26■■■■□ 3.56
SOBP-202ENST00000477448 MED14O60244 1454 aa37.25■■■■□ 3.55
SOBP-202ENST00000477448 ADGRB3O60242 1522 aa37.24■■■■□ 3.55
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.24■■■■□ 3.55
SOBP-202ENST00000477448 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
SOBP-202ENST00000477448 SLIT1O75093 1534 aa37.23■■■■□ 3.55
SOBP-202ENST00000477448 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.23■■■■□ 3.55
SOBP-202ENST00000477448 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.19■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 RGL3Q3MIN7 710 aa37.18■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 EID1Q9Y6B2 187 aa37.18■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.16■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 IQGAP1P46940 1657 aa37.15■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 IFT172Q9UG01 1749 aa37.15■■■■□ 3.54
SOBP-202ENST00000477448 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
SOBP-202ENST00000477448 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.1■■■■□ 3.53
SOBP-202ENST00000477448 PPLO60437 1756 aa37.08■■■■□ 3.53
SOBP-202ENST00000477448 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
SOBP-202ENST00000477448 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.02■■■■□ 3.52
SOBP-202ENST00000477448 ZFYVE9O95405 1425 aa37.01■■■■□ 3.52
SOBP-202ENST00000477448 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.01■■■■□ 3.52
SOBP-202ENST00000477448 NBPF8Q3BBV2 869 aa37■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 SLC26A8Q96RN1 970 aa37■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 MYOM2P54296 1465 aa36.99■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 STAC3Q96MF2 364 aa36.98■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.98■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.98■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 BCANQ96GW7 911 aa36.97■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.95■■■■□ 3.51
SOBP-202ENST00000477448 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
SOBP-202ENST00000477448 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.93■■■■□ 3.5
SOBP-202ENST00000477448 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.92■■■■□ 3.5
SOBP-202ENST00000477448 CPS1P31327 1500 aa36.92■■■■□ 3.5
SOBP-202ENST00000477448 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.89■■■■□ 3.5
SOBP-202ENST00000477448 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
SOBP-202ENST00000477448 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.88■■■■□ 3.49
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.87■■■■□ 3.49
SOBP-202ENST00000477448 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.85■■■■□ 3.49
SOBP-202ENST00000477448 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.84■■■■□ 3.49
SOBP-202ENST00000477448 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.84■■■■□ 3.49
SOBP-202ENST00000477448 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.82■■■■□ 3.48
SOBP-202ENST00000477448 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
SOBP-202ENST00000477448 PIK3C2GO75747 1445 aa36.78■■■■□ 3.48
SOBP-202ENST00000477448 KCNA6P17658 529 aa36.78■■■■□ 3.48
SOBP-202ENST00000477448 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.74■■■■□ 3.47
SOBP-202ENST00000477448 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SOBP-202ENST00000477448 TBX22Q9Y458 520 aa36.74■■■■□ 3.47
SOBP-202ENST00000477448 LAMC1P11047 1609 aa36.73■■■■□ 3.47
SOBP-202ENST00000477448 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
SOBP-202ENST00000477448 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.7■■■■□ 3.47
SOBP-202ENST00000477448 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.67■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 TOM1O60784 492 aa36.66■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 PIP4K2BP78356 416 aa36.66■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.64■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.64■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.64■■■■□ 3.46
SOBP-202ENST00000477448 TMEM94Q12767 1356 aa36.63■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.62■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 NWD1Q149M9 1564 aa36.61■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 ALKQ9UM73 1620 aa36.6■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
SOBP-202ENST00000477448 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 ADGRB1O14514 1584 aa36.57■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 PTPRUQ92729 1446 aa36.57■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 DIP2AQ14689 1571 aa36.56■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 USP47Q96K76 1375 aa36.56■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.54■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 METP08581 1390 aa36.54■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.52■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 PIK3R4Q99570 1358 aa36.52■■■■□ 3.44
SOBP-202ENST00000477448 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
SOBP-202ENST00000477448 HSPA1LP34931 641 aa36.44■■■■□ 3.42
SOBP-202ENST00000477448 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.44■■■■□ 3.42
SOBP-202ENST00000477448 C14orf37Q86TY3 774 aa36.39■■■■□ 3.42
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
SOBP-202ENST00000477448 MSH6P52701 1360 aa36.38■■■■□ 3.41
SOBP-202ENST00000477448 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
SOBP-202ENST00000477448 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.35■■■■□ 3.41
SOBP-202ENST00000477448 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
SOBP-202ENST00000477448 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
SOBP-202ENST00000477448 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.31■■■■□ 3.4
SOBP-202ENST00000477448 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.31■■■■□ 3.4
SOBP-202ENST00000477448 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.29■■■■□ 3.4
SOBP-202ENST00000477448 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.29■■■■□ 3.4
SOBP-202ENST00000477448 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
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