RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476675.5

PRKCE-208, Transcript of protein kinase C epsilon, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCE, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCE-208ENST00000476675 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.32■■■□□ 2.44
PRKCE-208ENST00000476675 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PRKCE-208ENST00000476675 CLTCL1P53675 1640 aa30.25■■■□□ 2.43
PRKCE-208ENST00000476675 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PRKCE-208ENST00000476675 BCANQ96GW7 911 aa30.24■■■□□ 2.43
PRKCE-208ENST00000476675 ALKQ9UM73 1620 aa30.24■■■□□ 2.43
PRKCE-208ENST00000476675 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.24■■■□□ 2.43
PRKCE-208ENST00000476675 TRPM2O94759 1503 aa30.22■■■□□ 2.43
PRKCE-208ENST00000476675 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 PIP4K2BP78356 416 aa30.19■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 FOXD1Q16676 465 aa30.17■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 KCNA6P17658 529 aa30.15■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 NWD1Q149M9 1564 aa30.15■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.14■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
PRKCE-208ENST00000476675 TOM1O60784 492 aa30.13■■■□□ 2.41
PRKCE-208ENST00000476675 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PRKCE-208ENST00000476675 TMEM94Q12767 1356 aa30.11■■■□□ 2.41
PRKCE-208ENST00000476675 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.08■■■□□ 2.41
PRKCE-208ENST00000476675 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PRKCE-208ENST00000476675 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.07■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 TBX22Q9Y458 520 aa30.07■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.07■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 KIF1BO60333 1816 aa30.06■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 HSPA1LP34931 641 aa30.05■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.05■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 DIP2AQ14689 1571 aa30.04■■■□□ 2.4
PRKCE-208ENST00000476675 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.01■■■□□ 2.39
PRKCE-208ENST00000476675 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.01■■■□□ 2.39
PRKCE-208ENST00000476675 PTPRUQ92729 1446 aa30■■■□□ 2.39
PRKCE-208ENST00000476675 METP08581 1390 aa29.93■■■□□ 2.38
PRKCE-208ENST00000476675 PIK3R4Q99570 1358 aa29.93■■■□□ 2.38
PRKCE-208ENST00000476675 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.92■■■□□ 2.38
PRKCE-208ENST00000476675 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.91■■■□□ 2.38
PRKCE-208ENST00000476675 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PRKCE-208ENST00000476675 PPLO60437 1756 aa29.89■■■□□ 2.38
PRKCE-208ENST00000476675 MSH6P52701 1360 aa29.88■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.88■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.88■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 RGL3Q3MIN7 710 aa29.85■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.84■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
PRKCE-208ENST00000476675 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.82■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 C14orf37Q86TY3 774 aa29.82■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.81■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 IFT172Q9UG01 1749 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
PRKCE-208ENST00000476675 SLAIN2Q9P270 581 aa29.76■■■□□ 2.35
PRKCE-208ENST00000476675 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PRKCE-208ENST00000476675 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.73■■■□□ 2.35
PRKCE-208ENST00000476675 ILDR2Q71H61 639 aa29.71■■■□□ 2.35
PRKCE-208ENST00000476675 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.7■■■□□ 2.35
PRKCE-208ENST00000476675 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.69■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 ATF3P18847 181 aa29.68■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.68■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 HRCP23327 699 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.66■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.66■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 PTCH1Q13635 1447 aa29.65■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 PIK3C2GO75747 1445 aa29.64■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.64■■■□□ 2.34
PRKCE-208ENST00000476675 DCCP43146 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 PHLPP1O60346 1717 aa29.62■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.61■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.6■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 MST1RQ04912 1400 aa29.6■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 STK26Q9P289 416 aa29.58■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.58■■■□□ 2.33
PRKCE-208ENST00000476675 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PRKCE-208ENST00000476675 MYOM2P54296 1465 aa29.57■■■□□ 2.32
PRKCE-208ENST00000476675 BRINP3Q76B58 766 aa29.56■■■□□ 2.32
PRKCE-208ENST00000476675 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PRKCE-208ENST00000476675 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PRKCE-208ENST00000476675 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.52■■■□□ 2.32
PRKCE-208ENST00000476675 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 TECPR2O15040 1411 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 ABCC11Q96J66 1382 aa29.47■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.47■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 LAMC1P11047 1609 aa29.45■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.45■■■□□ 2.31
PRKCE-208ENST00000476675 JCADQ9P266 1359 aa29.44■■■□□ 2.3
PRKCE-208ENST00000476675 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.44■■■□□ 2.3
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