RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 MYO5BQ9ULV0 1848 aa19.87■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 TRPM2O94759 1503 aa19.86■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 SOCS7O14512 581 aa19.86■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 PIP4K2BP78356 416 aa19.85■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.85■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 HRCP23327 699 aa19.83■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 HSPA1LP34931 641 aa19.83■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 ZFYVE9O95405 1425 aa19.83■□□□□ 0.76
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PRAME-211ENST00000476336 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
PRAME-211ENST00000476336 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.81■□□□□ 0.76
PRAME-211ENST00000476336 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.8■□□□□ 0.76
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.8■□□□□ 0.76
PRAME-211ENST00000476336 CLTCL1P53675 1640 aa19.79■□□□□ 0.76
PRAME-211ENST00000476336 ALKQ9UM73 1620 aa19.78■□□□□ 0.76
PRAME-211ENST00000476336 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.78■□□□□ 0.76
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PRAME-211ENST00000476336 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
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PRAME-211ENST00000476336 TBX22Q9Y458 520 aa19.73■□□□□ 0.75
PRAME-211ENST00000476336 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.73■□□□□ 0.75
PRAME-211ENST00000476336 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.73■□□□□ 0.75
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PRAME-211ENST00000476336 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.71■□□□□ 0.75
PRAME-211ENST00000476336 PIK3R4Q99570 1358 aa19.7■□□□□ 0.74
PRAME-211ENST00000476336 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
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PRAME-211ENST00000476336 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PRAME-211ENST00000476336 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
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PRAME-211ENST00000476336 NWD1Q149M9 1564 aa19.67■□□□□ 0.74
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PRAME-211ENST00000476336 FOXD1Q16676 465 aa19.66■□□□□ 0.74
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PRAME-211ENST00000476336 PPLO60437 1756 aa19.63■□□□□ 0.73
PRAME-211ENST00000476336 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.61■□□□□ 0.73
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.61■□□□□ 0.73
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PRAME-211ENST00000476336 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.6■□□□□ 0.73
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PRAME-211ENST00000476336 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.59■□□□□ 0.73
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PRAME-211ENST00000476336 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
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PRAME-211ENST00000476336 STAC3Q96MF2 364 aa19.55■□□□□ 0.72
PRAME-211ENST00000476336 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.54■□□□□ 0.72
PRAME-211ENST00000476336 MSH6P52701 1360 aa19.54■□□□□ 0.72
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PRAME-211ENST00000476336 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
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PRAME-211ENST00000476336 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa19.49■□□□□ 0.71
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PRAME-211ENST00000476336 MYOM2P54296 1465 aa19.48■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 C14orf37Q86TY3 774 aa19.48■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.48■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 SLAIN2Q9P270 581 aa19.47■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.47■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 LAMC1P11047 1609 aa19.47■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 PIK3C2GO75747 1445 aa19.46■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 CADPS2Q86UW7 1296 aa19.46■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.46■□□□□ 0.71
PRAME-211ENST00000476336 DCCP43146 1447 aa19.45■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 PTCH1Q13635 1447 aa19.45■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.44■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 ATF3P18847 181 aa19.43■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 PHLPP1O60346 1717 aa19.39■□□□□ 0.7
PRAME-211ENST00000476336 TECPR2O15040 1411 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.37■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 ABCC11Q96J66 1382 aa19.37■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 SIRT1Q96EB6 747 aa19.36■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 JCADQ9P266 1359 aa19.35■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.34■□□□□ 0.69
PRAME-211ENST00000476336 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
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PRAME-211ENST00000476336 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.32■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.31■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 POTEAQ6S8J7 498 aa19.31■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.3■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.3■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 STK26Q9P289 416 aa19.29■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.28■□□□□ 0.68
PRAME-211ENST00000476336 MST1RQ04912 1400 aa19.28■□□□□ 0.68
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