RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 CPS1P31327 1500 aa28.12■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 FBXO41Q8TF61 875 aa28.11■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.1■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.09■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 CLTCL1P53675 1640 aa28.08■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SYF2-203ENST00000474160 KIF1BO60333 1816 aa28.04■■■□□ 2.08
SYF2-203ENST00000474160 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.01■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.98■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 DIP2AQ14689 1571 aa27.97■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 BCANQ96GW7 911 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 TBX22Q9Y458 520 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-203ENST00000474160 FOXD1Q16676 465 aa27.95■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.93■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 KCNA6P17658 529 aa27.93■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.93■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 PIK3R4Q99570 1358 aa27.93■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.89■■■□□ 2.06
SYF2-203ENST00000474160 NWD1Q149M9 1564 aa27.89■■■□□ 2.05
SYF2-203ENST00000474160 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
SYF2-203ENST00000474160 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.88■■■□□ 2.05
SYF2-203ENST00000474160 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.87■■■□□ 2.05
SYF2-203ENST00000474160 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.84■■■□□ 2.05
SYF2-203ENST00000474160 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 TOM1O60784 492 aa27.81■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.81■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 PPLO60437 1756 aa27.81■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.79■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-203ENST00000474160 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SYF2-203ENST00000474160 TMEM94Q12767 1356 aa27.74■■■□□ 2.03
SYF2-203ENST00000474160 RGL3Q3MIN7 710 aa27.74■■■□□ 2.03
SYF2-203ENST00000474160 IFT172Q9UG01 1749 aa27.72■■■□□ 2.03
SYF2-203ENST00000474160 STAC3Q96MF2 364 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-203ENST00000474160 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SYF2-203ENST00000474160 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.7■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 ALKQ9UM73 1620 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 METP08581 1390 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 MYOM2P54296 1465 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 PTPRUQ92729 1446 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.66■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 MSH6P52701 1360 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 PIK3C2GO75747 1445 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-203ENST00000474160 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.64■■■□□ 2.01
SYF2-203ENST00000474160 PTCH1Q13635 1447 aa27.6■■■□□ 2.01
SYF2-203ENST00000474160 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.57■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 LAMC1P11047 1609 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 DCCP43146 1447 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 PIP4K2BP78356 416 aa27.55■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.54■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 C14orf37Q86TY3 774 aa27.54■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.54■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SYF2-203ENST00000474160 TECPR2O15040 1411 aa27.51■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.51■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 ABCC11Q96J66 1382 aa27.49■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 ATF3P18847 181 aa27.49■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.49■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 SLAIN2Q9P270 581 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 SIRT1Q96EB6 747 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-203ENST00000474160 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SYF2-203ENST00000474160 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-203ENST00000474160 HSPA1LP34931 641 aa27.42■■□□□ 1.98
SYF2-203ENST00000474160 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.42■■□□□ 1.98
SYF2-203ENST00000474160 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-203ENST00000474160 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.38■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.38■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 ADGRB1O14514 1584 aa27.37■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 DLC1Q96QB1 1528 aa27.36■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 STK26Q9P289 416 aa27.36■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 MST1RQ04912 1400 aa27.34■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.34■■□□□ 1.97
SYF2-203ENST00000474160 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-203ENST00000474160 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-203ENST00000474160 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.3■■□□□ 1.96
SYF2-203ENST00000474160 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-203ENST00000474160 NEUROD1Q13562 356 aa27.27■■□□□ 1.96
SYF2-203ENST00000474160 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SYF2-203ENST00000474160 BRINP3Q76B58 766 aa27.26■■□□□ 1.95
SYF2-203ENST00000474160 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms