RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472084.2

MTSS1-204, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene MTSS1, Length 707 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-204ENST00000472084 ZFYVE9O95405 1425 aa23.69■■□□□ 1.38
MTSS1-204ENST00000472084 PIP4K2BP78356 416 aa23.69■■□□□ 1.38
MTSS1-204ENST00000472084 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.68■■□□□ 1.38
MTSS1-204ENST00000472084 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.68■■□□□ 1.38
MTSS1-204ENST00000472084 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.68■■□□□ 1.38
MTSS1-204ENST00000472084 KCNA6P17658 529 aa23.67■■□□□ 1.38
MTSS1-204ENST00000472084 TRIM52Q96A61 297 aa23.64■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.62■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 TBX22Q9Y458 520 aa23.6■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.6■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.6■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 TMEM94Q12767 1356 aa23.58■■□□□ 1.37
MTSS1-204ENST00000472084 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 DIP2AQ14689 1571 aa23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 NWD1Q149M9 1564 aa23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 HSPA1LP34931 641 aa23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 TRPM2O94759 1503 aa23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 PIK3R4Q99570 1358 aa23.54■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 ALKQ9UM73 1620 aa23.54■■□□□ 1.36
MTSS1-204ENST00000472084 MSH6P52701 1360 aa23.51■■□□□ 1.35
MTSS1-204ENST00000472084 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.5■■□□□ 1.35
MTSS1-204ENST00000472084 CLTCL1P53675 1640 aa23.49■■□□□ 1.35
MTSS1-204ENST00000472084 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MTSS1-204ENST00000472084 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.49■■□□□ 1.35
MTSS1-204ENST00000472084 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
MTSS1-204ENST00000472084 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.45■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 C14orf37Q86TY3 774 aa23.45■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.44■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 KIF1BO60333 1816 aa23.44■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.43■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.41■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.41■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.4■■□□□ 1.34
MTSS1-204ENST00000472084 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.39■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 SLAIN2Q9P270 581 aa23.39■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.39■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.38■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.37■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 ATF3P18847 181 aa23.36■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.36■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 FOXD1Q16676 465 aa23.34■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.34■■□□□ 1.33
MTSS1-204ENST00000472084 PTPRUQ92729 1446 aa23.33■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 METP08581 1390 aa23.32■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 DCCP43146 1447 aa23.3■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 ILDR2Q71H61 639 aa23.29■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.27■■□□□ 1.32
MTSS1-204ENST00000472084 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.27■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 PPLO60437 1756 aa23.24■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 RGL3Q3MIN7 710 aa23.24■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.24■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 PTCH1Q13635 1447 aa23.23■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 SOCS7O14512 581 aa23.22■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.22■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 HRCP23327 699 aa23.21■■□□□ 1.31
MTSS1-204ENST00000472084 PHLPP1O60346 1717 aa23.19■■□□□ 1.3
MTSS1-204ENST00000472084 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.19■■□□□ 1.3
MTSS1-204ENST00000472084 JCADQ9P266 1359 aa23.19■■□□□ 1.3
MTSS1-204ENST00000472084 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
MTSS1-204ENST00000472084 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.15■■□□□ 1.3
MTSS1-204ENST00000472084 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
MTSS1-204ENST00000472084 BRINP3Q76B58 766 aa23.14■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 MST1RQ04912 1400 aa23.14■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.14■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 PIK3C2GO75747 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 IFT172Q9UG01 1749 aa23.12■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.11■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.11■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.1■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 MYOM2P54296 1465 aa23.08■■□□□ 1.29
MTSS1-204ENST00000472084 TECPR2O15040 1411 aa23.07■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 ABCC11Q96J66 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 STK26Q9P289 416 aa23.06■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 STAC3Q96MF2 364 aa23.05■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.05■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.04■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 LAMC1P11047 1609 aa23.04■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.02■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 SHPRHQ149N8 1683 aa23.02■■□□□ 1.28
MTSS1-204ENST00000472084 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
MTSS1-204ENST00000472084 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.01■■□□□ 1.27
MTSS1-204ENST00000472084 SIRT1Q96EB6 747 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms