RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467480.1

PIM3-202, Transcript of Pim-3 proto-oncogene, serine/threonine kinase, humanhuman

TSL 2

Gene PIM3, Length 723 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM3-202ENST00000467480 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa47.45■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 HFM1A2PYH4 1435 aa47.44■■■■■ 5.18
PIM3-202ENST00000467480 ZFYVE9O95405 1425 aa47.43■■■■■ 5.18
PIM3-202ENST00000467480 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP47.4■■■■■ 5.18
PIM3-202ENST00000467480 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa47.37■■■■■ 5.17
PIM3-202ENST00000467480 TRIM52Q96A61 297 aa47.36■■■■■ 5.17
PIM3-202ENST00000467480 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP47.36■■■■■ 5.17
PIM3-202ENST00000467480 KCNA6P17658 529 aa47.34■■■■■ 5.17
PIM3-202ENST00000467480 MYO5BQ9ULV0 1848 aa47.34■■■■■ 5.17
PIM3-202ENST00000467480 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
PIM3-202ENST00000467480 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa47.25■■■■■ 5.15
PIM3-202ENST00000467480 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
PIM3-202ENST00000467480 HSPA1LP34931 641 aa47.2■■■■■ 5.15
PIM3-202ENST00000467480 TMEM94Q12767 1356 aa47.19■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 ALKQ9UM73 1620 aa47.19■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 DISP3Q9P2K9 1392 aa47.18■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 TBX22Q9Y458 520 aa47.17■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 TRPM2O94759 1503 aa47.14■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 NWD1Q149M9 1564 aa47.13■■■■■ 5.14
PIM3-202ENST00000467480 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa47.08■■■■■ 5.13
PIM3-202ENST00000467480 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
PIM3-202ENST00000467480 CLTCL1P53675 1640 aa47.06■■■■■ 5.12
PIM3-202ENST00000467480 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
PIM3-202ENST00000467480 DIP2AQ14689 1571 aa47.05■■■■■ 5.12
PIM3-202ENST00000467480 PIK3R4Q99570 1358 aa46.99■■■■■ 5.11
PIM3-202ENST00000467480 MSH6P52701 1360 aa46.98■■■■■ 5.11
PIM3-202ENST00000467480 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
PIM3-202ENST00000467480 FOXD1Q16676 465 aa46.9■■■■■ 5.1
PIM3-202ENST00000467480 C14orf37Q86TY3 774 aa46.88■■■■■ 5.1
PIM3-202ENST00000467480 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa46.88■■■■■ 5.1
PIM3-202ENST00000467480 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa46.88■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 KIF1BO60333 1816 aa46.88■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.87■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa46.87■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 FAM135BQ49AJ0 1406 aa46.86■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 SETD5Q9C0A6 1442 aa46.84■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa46.84■■■■■ 5.09
PIM3-202ENST00000467480 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa46.8■■■■■ 5.08
PIM3-202ENST00000467480 PTPRUQ92729 1446 aa46.79■■■■■ 5.08
PIM3-202ENST00000467480 VGFO15240 615 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
PIM3-202ENST00000467480 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa46.79■■■■■ 5.08
PIM3-202ENST00000467480 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.77■■■■■ 5.08
PIM3-202ENST00000467480 SLAIN2Q9P270 581 aa46.75■■■■■ 5.07
PIM3-202ENST00000467480 METP08581 1390 aa46.74■■■■■ 5.07
PIM3-202ENST00000467480 ILDR2Q71H61 639 aa46.71■■■■■ 5.07
PIM3-202ENST00000467480 C19orf44Q9H6X5 657 aa46.71■■■■■ 5.07
PIM3-202ENST00000467480 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.07
PIM3-202ENST00000467480 ATF3P18847 181 aa46.68■■■■■ 5.06
PIM3-202ENST00000467480 CADPS2Q86UW7 1296 aa46.67■■■■■ 5.06
PIM3-202ENST00000467480 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa46.67■■■■■ 5.06
PIM3-202ENST00000467480 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.66■■■■■ 5.06
PIM3-202ENST00000467480 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
PIM3-202ENST00000467480 RGL3Q3MIN7 710 aa46.6■■■■■ 5.05
PIM3-202ENST00000467480 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
PIM3-202ENST00000467480 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP46.55■■■■■ 5.04
PIM3-202ENST00000467480 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.54■■■■■ 5.04
PIM3-202ENST00000467480 PPLO60437 1756 aa46.52■■■■■ 5.04
PIM3-202ENST00000467480 DCCP43146 1447 aa46.51■■■■■ 5.04
PIM3-202ENST00000467480 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa46.48■■■■■ 5.03
PIM3-202ENST00000467480 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa46.45■■■■■ 5.03
PIM3-202ENST00000467480 PTCH1Q13635 1447 aa46.42■■■■■ 5.02
PIM3-202ENST00000467480 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa46.42■■■■■ 5.02
PIM3-202ENST00000467480 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
PIM3-202ENST00000467480 PHLPP1O60346 1717 aa46.39■■■■■ 5.02
PIM3-202ENST00000467480 ROBO2Q9HCK4 1378 aa46.36■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 SOCS7O14512 581 aa46.35■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 HRCP23327 699 aa46.35■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 BRINP3Q76B58 766 aa46.34■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 JCADQ9P266 1359 aa46.33■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 MST1RQ04912 1400 aa46.32■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 PRAG1Q86YV5 1406 aa46.32■■■■■ 5.01
PIM3-202ENST00000467480 IFT172Q9UG01 1749 aa46.28■■■■■ 5
PIM3-202ENST00000467480 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
PIM3-202ENST00000467480 PIK3C2GO75747 1445 aa46.26■■■■■ 5
PIM3-202ENST00000467480 NALCNQ8IZF0 1738 aa46.25■■■■■ 5
PIM3-202ENST00000467480 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 4.99
PIM3-202ENST00000467480 STK26Q9P289 416 aa46.23■■■■■ 4.99
PIM3-202ENST00000467480 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa46.23■■■■■ 4.99
PIM3-202ENST00000467480 TMEM132EQ6IEE7 984 aa46.18■■■■■ 4.98
PIM3-202ENST00000467480 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
PIM3-202ENST00000467480 MYOM2P54296 1465 aa46.15■■■■■ 4.98
PIM3-202ENST00000467480 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.13■■■■■ 4.98
PIM3-202ENST00000467480 TECPR2O15040 1411 aa46.12■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 ABCC11Q96J66 1382 aa46.11■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa46.11■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 NRXN1Q9ULB1 1477 aa46.1■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 WAPLQ7Z5K2 1190 aa46.07■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
PIM3-202ENST00000467480 CFAP70Q5T0N1 1121 aa46.06■■■■■ 4.96
PIM3-202ENST00000467480 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
PIM3-202ENST00000467480 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
PIM3-202ENST00000467480 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
PIM3-202ENST00000467480 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
PIM3-202ENST00000467480 NHSL1Q5SYE7 1610 aa46■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms