RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466223.1

AGRN-204, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 459 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-204ENST00000466223 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
AGRN-204ENST00000466223 LTKP29376 864 aa23.28■■□□□ 1.32
AGRN-204ENST00000466223 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.27■■□□□ 1.32
AGRN-204ENST00000466223 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.27■■□□□ 1.32
AGRN-204ENST00000466223 BCANQ96GW7 911 aa23.27■■□□□ 1.32
AGRN-204ENST00000466223 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 MED14O60244 1454 aa23.25■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 RGL3Q3MIN7 710 aa23.23■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.23■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 ZFYVE9O95405 1425 aa23.23■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.23■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 IQGAP1P46940 1657 aa23.22■■□□□ 1.31
AGRN-204ENST00000466223 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
AGRN-204ENST00000466223 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
AGRN-204ENST00000466223 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.16■■□□□ 1.3
AGRN-204ENST00000466223 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.16■■□□□ 1.3
AGRN-204ENST00000466223 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
AGRN-204ENST00000466223 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.14■■□□□ 1.3
AGRN-204ENST00000466223 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.14■■□□□ 1.29
AGRN-204ENST00000466223 PPLO60437 1756 aa23.11■■□□□ 1.29
AGRN-204ENST00000466223 TBX22Q9Y458 520 aa23.09■■□□□ 1.29
AGRN-204ENST00000466223 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
AGRN-204ENST00000466223 NEUROD1Q13562 356 aa23.08■■□□□ 1.29
AGRN-204ENST00000466223 CERKQ8TCT0 537 aa23.08■■□□□ 1.29
AGRN-204ENST00000466223 STAC3Q96MF2 364 aa23.06■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.06■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.05■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 IFT172Q9UG01 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 DIP2AQ14689 1571 aa23.04■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.03■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.03■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.03■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.02■■□□□ 1.28
AGRN-204ENST00000466223 KCNA6P17658 529 aa23.01■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 PIK3R4Q99570 1358 aa23■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.99■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 MYOM2P54296 1465 aa22.98■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 CPS1P31327 1500 aa22.98■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.98■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.96■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AGRN-204ENST00000466223 ALKQ9UM73 1620 aa22.95■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 PIK3C2GO75747 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.94■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.93■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 METP08581 1390 aa22.92■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 TONSLQ96HA7 1378 aa22.92■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.92■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.92■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 NWD1Q149M9 1564 aa22.89■■□□□ 1.26
AGRN-204ENST00000466223 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.89■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 LAMC1P11047 1609 aa22.88■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.87■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.87■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 PTPRUQ92729 1446 aa22.86■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.86■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 C14orf37Q86TY3 774 aa22.84■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 STK26Q9P289 416 aa22.83■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 TMEM94Q12767 1356 aa22.83■■□□□ 1.25
AGRN-204ENST00000466223 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.82■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.8■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.79■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 TOM1O60784 492 aa22.78■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 MSH6P52701 1360 aa22.77■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 ABCC11Q96J66 1382 aa22.77■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.77■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.77■■□□□ 1.24
AGRN-204ENST00000466223 PTCH1Q13635 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.76■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 SIRT1Q96EB6 747 aa22.74■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.74■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.74■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.73■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 TECPR2O15040 1411 aa22.73■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.72■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 ADGRB1O14514 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 ATF3P18847 181 aa22.71■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.71■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 POGKQ9P215 609 aa22.71■■□□□ 1.23
AGRN-204ENST00000466223 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.7■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.7■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.69■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.69■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.69■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.68■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 PRAM1Q96QH2 718 aa22.67■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 PIP4K2BP78356 416 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms