RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
SIKE1-204ENST00000462123 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.38■■■□□ 2.61
SIKE1-204ENST00000462123 TBX22Q9Y458 520 aa31.36■■■□□ 2.61
SIKE1-204ENST00000462123 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
SIKE1-204ENST00000462123 BCANQ96GW7 911 aa31.34■■■□□ 2.61
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM52Q96A61 297 aa31.31■■■□□ 2.6
SIKE1-204ENST00000462123 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.3■■■□□ 2.6
SIKE1-204ENST00000462123 PIP4K2BP78356 416 aa31.28■■■□□ 2.6
SIKE1-204ENST00000462123 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 PIK3R4Q99570 1358 aa31.26■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM94Q12767 1356 aa31.24■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 TRPM2O94759 1503 aa31.23■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 NWD1Q149M9 1564 aa31.22■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 ALKQ9UM73 1620 aa31.21■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.21■■■□□ 2.59
SIKE1-204ENST00000462123 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.2■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 HSPA1LP34931 641 aa31.19■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 DIP2AQ14689 1571 aa31.18■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.18■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.14■■■□□ 2.58
SIKE1-204ENST00000462123 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.12■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.12■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.11■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 MSH6P52701 1360 aa31.09■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.09■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 CLTCL1P53675 1640 aa31.09■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.08■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.07■■■□□ 2.57
SIKE1-204ENST00000462123 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.05■■■□□ 2.56
SIKE1-204ENST00000462123 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SIKE1-204ENST00000462123 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.03■■■□□ 2.56
SIKE1-204ENST00000462123 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SIKE1-204ENST00000462123 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
SIKE1-204ENST00000462123 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.01■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 SLAIN2Q9P270 581 aa30.99■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.98■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 PTPRUQ92729 1446 aa30.98■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 HRCP23327 699 aa30.97■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 FOXD1Q16676 465 aa30.97■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.97■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 METP08581 1390 aa30.95■■■□□ 2.55
SIKE1-204ENST00000462123 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.95■■■□□ 2.54
SIKE1-204ENST00000462123 KIF1BO60333 1816 aa30.94■■■□□ 2.54
SIKE1-204ENST00000462123 C14orf37Q86TY3 774 aa30.93■■■□□ 2.54
SIKE1-204ENST00000462123 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.92■■■□□ 2.54
SIKE1-204ENST00000462123 ATF3P18847 181 aa30.9■■■□□ 2.54
SIKE1-204ENST00000462123 DCCP43146 1447 aa30.89■■■□□ 2.53
SIKE1-204ENST00000462123 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.89■■■□□ 2.53
SIKE1-204ENST00000462123 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.88■■■□□ 2.53
SIKE1-204ENST00000462123 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
SIKE1-204ENST00000462123 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.84■■■□□ 2.53
SIKE1-204ENST00000462123 ILDR2Q71H61 639 aa30.82■■■□□ 2.52
SIKE1-204ENST00000462123 RGL3Q3MIN7 710 aa30.81■■■□□ 2.52
SIKE1-204ENST00000462123 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
SIKE1-204ENST00000462123 PTCH1Q13635 1447 aa30.8■■■□□ 2.52
SIKE1-204ENST00000462123 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.79■■■□□ 2.52
SIKE1-204ENST00000462123 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.76■■■□□ 2.52
SIKE1-204ENST00000462123 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.75■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 PPLO60437 1756 aa30.72■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.7■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 JCADQ9P266 1359 aa30.7■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 BRINP3Q76B58 766 aa30.7■■■□□ 2.51
SIKE1-204ENST00000462123 SOCS7O14512 581 aa30.69■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 MST1RQ04912 1400 aa30.68■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 PIK3C2GO75747 1445 aa30.67■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 STAC3Q96MF2 364 aa30.67■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 ABCC11Q96J66 1382 aa30.65■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 TECPR2O15040 1411 aa30.64■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
SIKE1-204ENST00000462123 SIRT1Q96EB6 747 aa30.63■■■□□ 2.49
SIKE1-204ENST00000462123 MYOM2P54296 1465 aa30.62■■■□□ 2.49
SIKE1-204ENST00000462123 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.62■■■□□ 2.49
SIKE1-204ENST00000462123 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.6■■■□□ 2.49
SIKE1-204ENST00000462123 IFT172Q9UG01 1749 aa30.58■■■□□ 2.49
SIKE1-204ENST00000462123 PHLPP1O60346 1717 aa30.57■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.57■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.56■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.54■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 STK26Q9P289 416 aa30.53■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SIKE1-204ENST00000462123 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.51■■■□□ 2.47
SIKE1-204ENST00000462123 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.51■■■□□ 2.47
SIKE1-204ENST00000462123 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.48■■■□□ 2.47
SIKE1-204ENST00000462123 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms