RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.14■■□□□ 1.93
DDR1-241ENST00000460944 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
DDR1-241ENST00000460944 ZFYVE9O95405 1425 aa27.12■■□□□ 1.93
DDR1-241ENST00000460944 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
DDR1-241ENST00000460944 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
DDR1-241ENST00000460944 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
DDR1-241ENST00000460944 BCANQ96GW7 911 aa27.06■■□□□ 1.92
DDR1-241ENST00000460944 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.05■■□□□ 1.92
DDR1-241ENST00000460944 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
DDR1-241ENST00000460944 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.01■■□□□ 1.92
DDR1-241ENST00000460944 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.98■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 CERKQ8TCT0 537 aa26.98■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.97■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.97■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 CPS1P31327 1500 aa26.96■■□□□ 1.91
DDR1-241ENST00000460944 PPLO60437 1756 aa26.95■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.95■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 DIP2AQ14689 1571 aa26.93■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 RGL3Q3MIN7 710 aa26.92■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.9■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.9■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.9■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.89■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 TBX22Q9Y458 520 aa26.89■■□□□ 1.9
DDR1-241ENST00000460944 IFT172Q9UG01 1749 aa26.88■■□□□ 1.89
DDR1-241ENST00000460944 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.87■■□□□ 1.89
DDR1-241ENST00000460944 KCNA6P17658 529 aa26.85■■□□□ 1.89
DDR1-241ENST00000460944 NWD1Q149M9 1564 aa26.84■■□□□ 1.89
DDR1-241ENST00000460944 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
DDR1-241ENST00000460944 PIK3R4Q99570 1358 aa26.83■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.8■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.8■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 FBXO41Q8TF61 875 aa26.78■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.77■■□□□ 1.88
DDR1-241ENST00000460944 MYOM2P54296 1465 aa26.76■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 ALKQ9UM73 1620 aa26.76■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 METP08581 1390 aa26.72■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 PIK3C2GO75747 1445 aa26.72■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 TMEM94Q12767 1356 aa26.71■■□□□ 1.87
DDR1-241ENST00000460944 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.7■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 PTPRUQ92729 1446 aa26.7■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.69■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 STAC3Q96MF2 364 aa26.69■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.68■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 LAMC1P11047 1609 aa26.68■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.67■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 TOM1O60784 492 aa26.65■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.64■■□□□ 1.86
DDR1-241ENST00000460944 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 NEUROD1Q13562 356 aa26.62■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.62■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 C14orf37Q86TY3 774 aa26.61■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 MSH6P52701 1360 aa26.6■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 PTCH1Q13635 1447 aa26.59■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.58■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.58■■□□□ 1.85
DDR1-241ENST00000460944 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.57■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.55■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 STK26Q9P289 416 aa26.54■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 PIP4K2BP78356 416 aa26.53■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.52■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.52■■□□□ 1.84
DDR1-241ENST00000460944 TECPR2O15040 1411 aa26.51■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 ABCC11Q96J66 1382 aa26.5■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.5■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 TONSLQ96HA7 1378 aa26.49■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.49■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 ADGRB1O14514 1584 aa26.48■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.48■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 ATF3P18847 181 aa26.47■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.47■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.47■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 DCCP43146 1447 aa26.47■■□□□ 1.83
DDR1-241ENST00000460944 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.43■■□□□ 1.82
DDR1-241ENST00000460944 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.42■■□□□ 1.82
DDR1-241ENST00000460944 DLC1Q96QB1 1528 aa26.42■■□□□ 1.82
DDR1-241ENST00000460944 SIRT1Q96EB6 747 aa26.41■■□□□ 1.82
DDR1-241ENST00000460944 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.4■■□□□ 1.82
DDR1-241ENST00000460944 SLAIN2Q9P270 581 aa26.4■■□□□ 1.82
DDR1-241ENST00000460944 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.38■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.37■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.37■■□□□ 1.81
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