RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.47■■■□□ 2.47
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.45■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.41■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.41■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.4■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
RPUSD3-210ENST00000460909 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.38■■■□□ 2.45
RPUSD3-210ENST00000460909 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
RPUSD3-210ENST00000460909 CERKQ8TCT0 537 aa30.34■■■□□ 2.45
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.33■■■□□ 2.45
RPUSD3-210ENST00000460909 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.33■■■□□ 2.45
RPUSD3-210ENST00000460909 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.31■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 PPLO60437 1756 aa30.31■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.3■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.29■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 BCANQ96GW7 911 aa30.27■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.27■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 CPS1P31327 1500 aa30.27■■■□□ 2.44
RPUSD3-210ENST00000460909 RGL3Q3MIN7 710 aa30.26■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 IFT172Q9UG01 1749 aa30.26■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 TBX22Q9Y458 520 aa30.26■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 DIP2AQ14689 1571 aa30.24■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.21■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
RPUSD3-210ENST00000460909 NWD1Q149M9 1564 aa30.2■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 KCNA6P17658 529 aa30.19■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.17■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 PIK3R4Q99570 1358 aa30.15■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.15■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
RPUSD3-210ENST00000460909 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.12■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 METP08581 1390 aa30.11■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 PTPRUQ92729 1446 aa30.11■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 ALKQ9UM73 1620 aa30.11■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 MYOM2P54296 1465 aa30.09■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 FBXO41Q8TF61 875 aa30.09■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.08■■■□□ 2.41
RPUSD3-210ENST00000460909 PIK3C2GO75747 1445 aa30.07■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.04■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM94Q12767 1356 aa30.03■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.02■■■□□ 2.4
RPUSD3-210ENST00000460909 DCAF11Q8TEB1 546 aa30■■■□□ 2.39
RPUSD3-210ENST00000460909 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RPUSD3-210ENST00000460909 STAC3Q96MF2 364 aa29.98■■■□□ 2.39
RPUSD3-210ENST00000460909 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
RPUSD3-210ENST00000460909 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.96■■■□□ 2.39
RPUSD3-210ENST00000460909 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.95■■■□□ 2.39
RPUSD3-210ENST00000460909 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.94■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 LAMC1P11047 1609 aa29.93■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.93■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.92■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.91■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 NEUROD1Q13562 356 aa29.9■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.89■■■□□ 2.38
RPUSD3-210ENST00000460909 PTCH1Q13635 1447 aa29.88■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.88■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 TOM1O60784 492 aa29.87■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.87■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 TECPR2O15040 1411 aa29.85■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.83■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 ADGRB1O14514 1584 aa29.83■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 MSH6P52701 1360 aa29.83■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCC11Q96J66 1382 aa29.83■■■□□ 2.37
RPUSD3-210ENST00000460909 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.8■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 STK26Q9P289 416 aa29.8■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.78■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.77■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 C14orf37Q86TY3 774 aa29.77■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.77■■■□□ 2.36
RPUSD3-210ENST00000460909 PIP4K2BP78356 416 aa29.76■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 DCCP43146 1447 aa29.73■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 SIRT1Q96EB6 747 aa29.73■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.72■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.71■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.71■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 DLC1Q96QB1 1528 aa29.71■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.71■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.7■■■□□ 2.35
RPUSD3-210ENST00000460909 TONSLQ96HA7 1378 aa29.69■■■□□ 2.34
RPUSD3-210ENST00000460909 ATF3P18847 181 aa29.69■■■□□ 2.34
RPUSD3-210ENST00000460909 SLAIN2Q9P270 581 aa29.69■■■□□ 2.34
RPUSD3-210ENST00000460909 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.68■■■□□ 2.34
RPUSD3-210ENST00000460909 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.65■■■□□ 2.34
RPUSD3-210ENST00000460909 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms