RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452174.5

CERKL-208, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CERKL, Length 1,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-208ENST00000452174 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.97■■■□□ 2.23
CERKL-208ENST00000452174 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CERKL-208ENST00000452174 CLTCL1P53675 1640 aa28.95■■■□□ 2.23
CERKL-208ENST00000452174 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.94■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 BCANQ96GW7 911 aa28.94■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.93■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.91■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 FOXD1Q16676 465 aa28.89■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.89■■■□□ 2.22
CERKL-208ENST00000452174 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.88■■■□□ 2.21
CERKL-208ENST00000452174 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CERKL-208ENST00000452174 KIF1BO60333 1816 aa28.87■■■□□ 2.21
CERKL-208ENST00000452174 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.86■■■□□ 2.21
CERKL-208ENST00000452174 KCNA6P17658 529 aa28.84■■■□□ 2.21
CERKL-208ENST00000452174 TBX22Q9Y458 520 aa28.81■■■□□ 2.2
CERKL-208ENST00000452174 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.8■■■□□ 2.2
CERKL-208ENST00000452174 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.78■■■□□ 2.2
CERKL-208ENST00000452174 TOM1O60784 492 aa28.77■■■□□ 2.2
CERKL-208ENST00000452174 NWD1Q149M9 1564 aa28.77■■■□□ 2.2
CERKL-208ENST00000452174 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.76■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 DIP2AQ14689 1571 aa28.76■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 HRCP23327 699 aa28.73■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.72■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 TMEM94Q12767 1356 aa28.71■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.71■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.7■■■□□ 2.19
CERKL-208ENST00000452174 PIK3R4Q99570 1358 aa28.7■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 ALKQ9UM73 1620 aa28.69■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 PIP4K2BP78356 416 aa28.69■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 PPLO60437 1756 aa28.65■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.64■■■□□ 2.18
CERKL-208ENST00000452174 PTPRUQ92729 1446 aa28.63■■■□□ 2.17
CERKL-208ENST00000452174 RGL3Q3MIN7 710 aa28.62■■■□□ 2.17
CERKL-208ENST00000452174 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.62■■■□□ 2.17
CERKL-208ENST00000452174 METP08581 1390 aa28.6■■■□□ 2.17
CERKL-208ENST00000452174 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.57■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.56■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 MSH6P52701 1360 aa28.55■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 IFT172Q9UG01 1749 aa28.54■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 HSPA1LP34931 641 aa28.53■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.53■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CERKL-208ENST00000452174 C14orf37Q86TY3 774 aa28.5■■■□□ 2.15
CERKL-208ENST00000452174 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.45■■■□□ 2.15
CERKL-208ENST00000452174 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.45■■■□□ 2.15
CERKL-208ENST00000452174 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 SLAIN2Q9P270 581 aa28.43■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 PIK3C2GO75747 1445 aa28.42■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 MYOM2P54296 1465 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.39■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 ATF3P18847 181 aa28.39■■■□□ 2.14
CERKL-208ENST00000452174 PTCH1Q13635 1447 aa28.39■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.38■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.38■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.37■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 DCCP43146 1447 aa28.35■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.34■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.33■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.33■■■□□ 2.13
CERKL-208ENST00000452174 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.31■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.31■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.3■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 STK26Q9P289 416 aa28.3■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.29■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 LAMC1P11047 1609 aa28.28■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 TECPR2O15040 1411 aa28.28■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 ABCC11Q96J66 1382 aa28.28■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.27■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 STAC3Q96MF2 364 aa28.26■■■□□ 2.12
CERKL-208ENST00000452174 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CERKL-208ENST00000452174 MST1RQ04912 1400 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-208ENST00000452174 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-208ENST00000452174 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.22■■■□□ 2.11
CERKL-208ENST00000452174 PHLPP1O60346 1717 aa28.21■■■□□ 2.11
CERKL-208ENST00000452174 BRINP3Q76B58 766 aa28.21■■■□□ 2.11
CERKL-208ENST00000452174 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.18■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 SIRT1Q96EB6 747 aa28.18■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 ADGRB1O14514 1584 aa28.16■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.15■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CERKL-208ENST00000452174 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms