RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448514.1

GGTLC2-202, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-202ENST00000448514 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.52■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 BCANQ96GW7 911 aa23.52■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 NWD1Q149M9 1564 aa23.52■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.51■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.5■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 TBX22Q9Y458 520 aa23.49■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.47■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 NUP155O75694 1391 aa23.46■■□□□ 1.35
GGTLC2-202ENST00000448514 MSH6P52701 1360 aa23.45■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 E9PCH4 1651 aa23.44■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.43■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 SLAIN2Q9P270 581 aa23.41■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 PIK3R4Q99570 1358 aa23.4■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.4■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 ITGAEP38570 1179 aa23.4■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.4■■□□□ 1.34
GGTLC2-202ENST00000448514 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GGTLC2-202ENST00000448514 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
GGTLC2-202ENST00000448514 DIP2AQ14689 1571 aa23.37■■□□□ 1.33
GGTLC2-202ENST00000448514 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GGTLC2-202ENST00000448514 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GGTLC2-202ENST00000448514 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GGTLC2-202ENST00000448514 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.32■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 TRPM2O94759 1503 aa23.29■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 C14orf37Q86TY3 774 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.28■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 JCADQ9P266 1359 aa23.27■■□□□ 1.32
GGTLC2-202ENST00000448514 ATF3P18847 181 aa23.26■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 PTPRUQ92729 1446 aa23.25■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 NAIPQ13075 1403 aa23.24■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.23■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 PHLPP1O60346 1717 aa23.22■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 POTEAQ6S8J7 498 aa23.21■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 DCCP43146 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GGTLC2-202ENST00000448514 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.19■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.18■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 METP08581 1390 aa23.17■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 HFM1A2PYH4 1435 aa23.16■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 BRINP3Q76B58 766 aa23.15■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 CLTCL1P53675 1640 aa23.15■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.14■■□□□ 1.3
GGTLC2-202ENST00000448514 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GGTLC2-202ENST00000448514 TRIM52Q96A61 297 aa23.1■■□□□ 1.29
GGTLC2-202ENST00000448514 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.09■■□□□ 1.29
GGTLC2-202ENST00000448514 MST1RQ04912 1400 aa23.09■■□□□ 1.29
GGTLC2-202ENST00000448514 LRP6O75581 1613 aa23.08■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.08■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.07■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 SHPRHQ149N8 1683 aa23.06■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.06■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 KIF1BO60333 1816 aa23.05■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 PTCH1Q13635 1447 aa23.03■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.03■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GGTLC2-202ENST00000448514 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.98■■□□□ 1.27
GGTLC2-202ENST00000448514 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.98■■□□□ 1.27
GGTLC2-202ENST00000448514 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.97■■□□□ 1.27
GGTLC2-202ENST00000448514 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.96■■□□□ 1.27
GGTLC2-202ENST00000448514 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.92■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 RXRBP28702 533 aa22.92■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 FOXD1Q16676 465 aa22.92■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.91■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 PPLO60437 1756 aa22.91■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.9■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 LAMC1P11047 1609 aa22.9■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 AFF2P51816 1311 aa22.89■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
GGTLC2-202ENST00000448514 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.89■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.89■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 ORAI2Q96SN7 254 aa22.88■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.87■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 TECPR2O15040 1411 aa22.84■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 RGL3Q3MIN7 710 aa22.84■■□□□ 1.25
GGTLC2-202ENST00000448514 C8orf37Q96NL8 207 aa22.84■■□□□ 1.25
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