RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444973.5

NEK6-209, Transcript of NIMA related kinase 6, human

TSL 5

Gene NEK6, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK6-209	ENST00000444973	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		43.56	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.56	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.56	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	ROCK1	Q13464	1354 aa		43.53	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.52	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.52	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		43.51	■■■■■ 4.56
NEK6-209	ENST00000444973	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973		E9PCH4	1651 aa		43.49	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.48	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.48	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	ITGAE	P38570	1179 aa		43.47	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
NEK6-209	ENST00000444973	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		43.44	■■■■■ 4.54
NEK6-209	ENST00000444973	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.41	■■■■■ 4.54
NEK6-209	ENST00000444973	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		43.39	■■■■■ 4.54
NEK6-209	ENST00000444973	NUP155	O75694	1391 aa		43.38	■■■■■ 4.53
NEK6-209	ENST00000444973	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
NEK6-209	ENST00000444973	MSH6	P52701	1360 aa		43.36	■■■■■ 4.53
NEK6-209	ENST00000444973	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.34	■■■■■ 4.53
NEK6-209	ENST00000444973	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.33	■■■■■ 4.53
NEK6-209	ENST00000444973	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.3	■■■■■ 4.52
NEK6-209	ENST00000444973	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.28	■■■■■ 4.52
NEK6-209	ENST00000444973	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
NEK6-209	ENST00000444973	SLAIN2	Q9P270	581 aa		43.24	■■■■■ 4.51
NEK6-209	ENST00000444973	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.19	■■■■■ 4.5
NEK6-209	ENST00000444973	C14orf37	Q86TY3	774 aa		43.16	■■■■■ 4.5
NEK6-209	ENST00000444973	PHLPP1	O60346	1717 aa		43.12	■■■■■ 4.49
NEK6-209	ENST00000444973	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.12	■■■■■ 4.49
NEK6-209	ENST00000444973	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.12	■■■■■ 4.49
NEK6-209	ENST00000444973	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.1	■■■■■ 4.49
NEK6-209	ENST00000444973	TRPM2	O94759	1503 aa		43.09	■■■■■ 4.49
NEK6-209	ENST00000444973	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.06	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.04	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	POTEA	Q6S8J7	498 aa		43.02	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		43.02	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	JCAD	Q9P266	1359 aa		43.01	■■■■■ 4.48
NEK6-209	ENST00000444973	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	43	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	ATF3	P18847	181 aa		42.99	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.99	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.96	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	NAIP	Q13075	1403 aa		42.95	■■■■■ 4.47
NEK6-209	ENST00000444973	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.93	■■■■■ 4.46
NEK6-209	ENST00000444973	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
NEK6-209	ENST00000444973	MET	P08581	1390 aa		42.89	■■■■■ 4.46
NEK6-209	ENST00000444973	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
NEK6-209	ENST00000444973	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.86	■■■■■ 4.45
NEK6-209	ENST00000444973	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.82	■■■■■ 4.45
NEK6-209	ENST00000444973	LRP6	O75581	1613 aa		42.82	■■■■■ 4.44
NEK6-209	ENST00000444973	DCC	P43146	1447 aa		42.8	■■■■■ 4.44
NEK6-209	ENST00000444973	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.78	■■■■■ 4.44
NEK6-209	ENST00000444973	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.78	■■■■■ 4.44
NEK6-209	ENST00000444973	KIF1B	O60333	1816 aa		42.76	■■■■■ 4.44
NEK6-209	ENST00000444973	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.74	■■■■■ 4.43
NEK6-209	ENST00000444973	MST1R	Q04912	1400 aa		42.73	■■■■■ 4.43
NEK6-209	ENST00000444973	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.73	■■■■■ 4.43
NEK6-209	ENST00000444973	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.72	■■■■■ 4.43
NEK6-209	ENST00000444973	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
NEK6-209	ENST00000444973	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.68	■■■■■ 4.42
NEK6-209	ENST00000444973	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
NEK6-209	ENST00000444973	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
NEK6-209	ENST00000444973	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.64	■■■■■ 4.42
NEK6-209	ENST00000444973	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.6	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.57	■■■■■ 4.41
NEK6-209	ENST00000444973	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
NEK6-209	ENST00000444973	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NEK6-209	ENST00000444973	FOXD1	Q16676	465 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NEK6-209	ENST00000444973	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NEK6-209	ENST00000444973	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NEK6-209	ENST00000444973	PPL	O60437	1756 aa		42.48	■■■■■ 4.39
NEK6-209	ENST00000444973	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
NEK6-209	ENST00000444973	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.48	■■■■■ 4.39
NEK6-209	ENST00000444973	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.42	■■■■■ 4.38
NEK6-209	ENST00000444973	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.41	■■■■■ 4.38
NEK6-209	ENST00000444973	AFF2	P51816	1311 aa		42.41	■■■■■ 4.38
NEK6-209	ENST00000444973	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.37	■■■■■ 4.37
NEK6-209	ENST00000444973	RXRB	P28702	533 aa		42.36	■■■■■ 4.37
NEK6-209	ENST00000444973	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.35	■■■■■ 4.37
NEK6-209	ENST00000444973	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NEK6-209	ENST00000444973	C8orf37	Q96NL8	207 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NEK6-209	ENST00000444973	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.32	■■■■■ 4.37
NEK6-209	ENST00000444973	LAMC1	P11047	1609 aa		42.31	■■■■■ 4.36
NEK6-209	ENST00000444973	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.29	■■■■■ 4.36
NEK6-209	ENST00000444973	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.28	■■■■■ 4.36
NEK6-209	ENST00000444973	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
NEK6-209	ENST00000444973	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	42.25	■■■■■ 4.35
NEK6-209	ENST00000444973	ADAMTS2	O95450	1211 aa		42.24	■■■■■ 4.35
NEK6-209	ENST00000444973	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	42.23	■■■■■ 4.35
NEK6-209	ENST00000444973	STK26	Q9P289	416 aa		42.22	■■■■■ 4.35

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