RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.24■■■■■ 4.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CERKQ8TCT0 537 aa40.13■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.11■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.09■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.06■■■■■ 4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.05■■■■■ 4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BCANQ96GW7 911 aa40.02■■■■■ 4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.01■■■■■ 4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CPS1P31327 1500 aa40.01■■■■□ 3.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPLO60437 1756 aa39.95■■■■□ 3.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.95■■■■□ 3.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.95■■■■□ 3.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXO41Q8TF61 875 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DIP2AQ14689 1571 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.89■■■■□ 3.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBX22Q9Y458 520 aa39.87■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IFT172Q9UG01 1749 aa39.87■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NWD1Q149M9 1564 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RGL3Q3MIN7 710 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.82■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCNA6P17658 529 aa39.82■■■■□ 3.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIK3R4Q99570 1358 aa39.75■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALKQ9UM73 1620 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRUQ92729 1446 aa39.67■■■■□ 3.94
HOXD-AS2-202ENST00000440016 METP08581 1390 aa39.66■■■■□ 3.94
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYOM2P54296 1465 aa39.62■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM94Q12767 1356 aa39.62■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.61■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIK3C2GO75747 1445 aa39.59■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.57■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TOM1O60784 492 aa39.51■■■■□ 3.92
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.49■■■■□ 3.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.49■■■■□ 3.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LAMC1P11047 1609 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.46■■■■□ 3.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.45■■■■□ 3.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.45■■■■□ 3.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.44■■■■□ 3.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STAC3Q96MF2 364 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MSH6P52701 1360 aa39.41■■■■□ 3.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.4■■■■□ 3.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTCH1Q13635 1447 aa39.4■■■■□ 3.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIP4K2BP78356 416 aa39.38■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.38■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C14orf37Q86TY3 774 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.36■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.35■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.34■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NEUROD1Q13562 356 aa39.34■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.31■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.3■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TECPR2O15040 1411 aa39.3■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STK26Q9P289 416 aa39.29■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCC11Q96J66 1382 aa39.27■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADGRB1O14514 1584 aa39.26■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.26■■■■□ 3.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.25■■■■□ 3.87
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCCP43146 1447 aa39.23■■■■□ 3.87
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa39.21■■■■□ 3.87
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATF3P18847 181 aa39.2■■■■□ 3.87
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.2■■■■□ 3.87
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.19■■■■□ 3.86
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLAIN2Q9P270 581 aa39.18■■■■□ 3.86
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.17■■■■□ 3.86
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.15■■■■□ 3.86
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.13■■■■□ 3.85
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIRT1Q96EB6 747 aa39.13■■■■□ 3.85
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLC1Q96QB1 1528 aa39.13■■■■□ 3.85
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HSPA1LP34931 641 aa39.12■■■■□ 3.85
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MST1RQ04912 1400 aa39.08■■■■□ 3.85
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TONSLQ96HA7 1378 aa39.07■■■■□ 3.84
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.06■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.1 ms