RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431095.5

H19-208, H19, imprinted maternally expressed transcript, human

TSL 5

Gene H19, Length 1,481 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
H19-208	ENST00000431095	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.11	■■■□□ 2.89
H19-208	ENST00000431095	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.08	■■■□□ 2.89
H19-208	ENST00000431095	KIF1B	O60333	1816 aa		33.08	■■■□□ 2.89
H19-208	ENST00000431095	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.06	■■■□□ 2.88
H19-208	ENST00000431095	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
H19-208	ENST00000431095	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
H19-208	ENST00000431095	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.02	■■■□□ 2.88
H19-208	ENST00000431095	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33	■■■□□ 2.87
H19-208	ENST00000431095	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.99	■■■□□ 2.87
H19-208	ENST00000431095	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
H19-208	ENST00000431095	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
H19-208	ENST00000431095	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.96	■■■□□ 2.87
H19-208	ENST00000431095	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.93	■■■□□ 2.86
H19-208	ENST00000431095	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.93	■■■□□ 2.86
H19-208	ENST00000431095	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.92	■■■□□ 2.86
H19-208	ENST00000431095	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
H19-208	ENST00000431095	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.9	■■■□□ 2.86
H19-208	ENST00000431095	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.88	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.88	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.87	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.85	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	PPL	O60437	1756 aa		32.83	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.83	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	CPS1	P31327	1500 aa		32.83	■■■□□ 2.85
H19-208	ENST00000431095	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.81	■■■□□ 2.84
H19-208	ENST00000431095	KCNA6	P17658	529 aa		32.8	■■■□□ 2.84
H19-208	ENST00000431095	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.78	■■■□□ 2.84
H19-208	ENST00000431095	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.77	■■■□□ 2.84
H19-208	ENST00000431095	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.75	■■■□□ 2.83
H19-208	ENST00000431095	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.75	■■■□□ 2.83
H19-208	ENST00000431095	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.75	■■■□□ 2.83
H19-208	ENST00000431095	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.74	■■■□□ 2.83
H19-208	ENST00000431095	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.71	■■■□□ 2.83
H19-208	ENST00000431095	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.69	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	MYOM2	P54296	1465 aa		32.68	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.68	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	MET	P08581	1390 aa		32.67	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.66	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.66	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.66	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.65	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.64	■■■□□ 2.82
H19-208	ENST00000431095	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.63	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.62	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.6	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.59	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
H19-208	ENST00000431095	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.57	■■■□□ 2.8
H19-208	ENST00000431095	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.56	■■■□□ 2.8
H19-208	ENST00000431095	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
H19-208	ENST00000431095	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.52	■■■□□ 2.8
H19-208	ENST00000431095	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.51	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.5	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.5	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	LAMC1	P11047	1609 aa		32.48	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.46	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	TOM1	O60784	492 aa		32.46	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.46	■■■□□ 2.79
H19-208	ENST00000431095	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.45	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.44	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.44	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.43	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.41	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	TECPR2	O15040	1411 aa		32.41	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	MSH6	P52701	1360 aa		32.4	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.4	■■■□□ 2.78
H19-208	ENST00000431095	STK26	Q9P289	416 aa		32.37	■■■□□ 2.77
H19-208	ENST00000431095	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.37	■■■□□ 2.77
H19-208	ENST00000431095	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.36	■■■□□ 2.77
H19-208	ENST00000431095	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.35	■■■□□ 2.77
H19-208	ENST00000431095	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.35	■■■□□ 2.77
H19-208	ENST00000431095	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.32	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.31	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.3	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.29	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	DCC	P43146	1447 aa		32.29	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.29	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.28	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	ATF3	P18847	181 aa		32.27	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.27	■■■□□ 2.76
H19-208	ENST00000431095	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.25	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.25	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.24	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.23	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.23	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
H19-208	ENST00000431095	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.21	■■■□□ 2.75

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