RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
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LMO1-202ENST00000428101 KCNA6P17658 529 aa41.42■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.38■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 ILDR2Q71H61 639 aa41.36■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 BCANQ96GW7 911 aa41.36■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 NAIPQ13075 1403 aa41.35■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 TMEM94Q12767 1356 aa41.32■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 NWD1Q149M9 1564 aa41.31■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.3■■■■■ 4.2
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LMO1-202ENST00000428101 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
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LMO1-202ENST00000428101 HFM1A2PYH4 1435 aa41.2■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.2■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
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LMO1-202ENST00000428101 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.1■■■■■ 4.17
LMO1-202ENST00000428101 CLTCL1P53675 1640 aa41.1■■■■■ 4.17
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LMO1-202ENST00000428101 PIK3R4Q99570 1358 aa41.06■■■■■ 4.16
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LMO1-202ENST00000428101 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.98■■■■■ 4.15
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LMO1-202ENST00000428101 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.94■■■■■ 4.14
LMO1-202ENST00000428101 C14orf37Q86TY3 774 aa40.86■■■■■ 4.13
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LMO1-202ENST00000428101 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.84■■■■■ 4.13
LMO1-202ENST00000428101 FOXD1Q16676 465 aa40.81■■■■■ 4.12
LMO1-202ENST00000428101 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
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LMO1-202ENST00000428101 PHLPP1O60346 1717 aa40.75■■■■■ 4.11
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LMO1-202ENST00000428101 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.72■■■■■ 4.11
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LMO1-202ENST00000428101 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
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LMO1-202ENST00000428101 STK26Q9P289 416 aa40.26■■■■■ 4.04
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LMO1-202ENST00000428101 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.21■■■■■ 4.03
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