RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.53■■■■■ 4.4
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNA6P17658 529 aa42.5■■■■■ 4.39
TRIOBP-209ENST00000428075 ILDR2Q71H61 639 aa42.48■■■■■ 4.39
TRIOBP-209ENST00000428075 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
TRIOBP-209ENST00000428075 NAIPQ13075 1403 aa42.47■■■■■ 4.39
TRIOBP-209ENST00000428075 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.47■■■■■ 4.39
TRIOBP-209ENST00000428075 CHGAP10645 457 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM94Q12767 1356 aa42.41■■■■■ 4.38
TRIOBP-209ENST00000428075 NWD1Q149M9 1564 aa42.4■■■■■ 4.38
TRIOBP-209ENST00000428075 BCANQ96GW7 911 aa42.4■■■■■ 4.38
TRIOBP-209ENST00000428075 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.35■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.32■■■■■ 4.37
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.31■■■■■ 4.36
TRIOBP-209ENST00000428075 TBX22Q9Y458 520 aa42.31■■■■■ 4.36
TRIOBP-209ENST00000428075 HFM1A2PYH4 1435 aa42.29■■■■■ 4.36
TRIOBP-209ENST00000428075 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
TRIOBP-209ENST00000428075 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
TRIOBP-209ENST00000428075 CLTCL1P53675 1640 aa42.19■■■■■ 4.34
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM135BQ49AJ0 1406 aa42.18■■■■■ 4.34
TRIOBP-209ENST00000428075 DIP2AQ14689 1571 aa42.17■■■■■ 4.34
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPM2O94759 1503 aa42.16■■■■■ 4.34
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM52Q96A61 297 aa42.13■■■■■ 4.33
TRIOBP-209ENST00000428075 PIK3R4Q99570 1358 aa42.12■■■■■ 4.33
TRIOBP-209ENST00000428075 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.11■■■■■ 4.33
TRIOBP-209ENST00000428075 PTPRUQ92729 1446 aa42.1■■■■■ 4.33
TRIOBP-209ENST00000428075 MSH6P52701 1360 aa42.09■■■■■ 4.33
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
TRIOBP-209ENST00000428075 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.05■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa42.05■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SOCS7O14512 581 aa42.04■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.04■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa42.03■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa42.01■■■■■ 4.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SLAIN2Q9P270 581 aa42■■■■■ 4.31
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF1BO60333 1816 aa41.97■■■■■ 4.31
TRIOBP-209ENST00000428075 METP08581 1390 aa41.95■■■■■ 4.31
TRIOBP-209ENST00000428075 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
TRIOBP-209ENST00000428075 FOXD1Q16676 465 aa41.92■■■■■ 4.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
TRIOBP-209ENST00000428075 C14orf37Q86TY3 774 aa41.89■■■■■ 4.3
TRIOBP-209ENST00000428075 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.89■■■■■ 4.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.81■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.8■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.78■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 ATF3P18847 181 aa41.78■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 PHLPP1O60346 1717 aa41.76■■■■■ 4.28
TRIOBP-209ENST00000428075 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PPLO60437 1756 aa41.73■■■■■ 4.27
TRIOBP-209ENST00000428075 DCCP43146 1447 aa41.71■■■■■ 4.27
TRIOBP-209ENST00000428075 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.69■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.68■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.67■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 BRINP3Q76B58 766 aa41.65■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.64■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 JCADQ9P266 1359 aa41.63■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 MST1RQ04912 1400 aa41.63■■■■■ 4.26
TRIOBP-209ENST00000428075 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.62■■■■■ 4.25
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.6■■■■■ 4.25
TRIOBP-209ENST00000428075 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.6■■■■■ 4.25
TRIOBP-209ENST00000428075 RGL3Q3MIN7 710 aa41.59■■■■■ 4.25
TRIOBP-209ENST00000428075 PTCH1Q13635 1447 aa41.59■■■■■ 4.25
TRIOBP-209ENST00000428075 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.58■■■■■ 4.25
TRIOBP-209ENST00000428075 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.55■■■■■ 4.24
TRIOBP-209ENST00000428075 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.54■■■■■ 4.24
TRIOBP-209ENST00000428075 IFT172Q9UG01 1749 aa41.52■■■■■ 4.24
TRIOBP-209ENST00000428075 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.49■■■■■ 4.23
TRIOBP-209ENST00000428075 POTEAQ6S8J7 498 aa41.48■■■■■ 4.23
TRIOBP-209ENST00000428075 LRP6O75581 1613 aa41.46■■■■■ 4.23
TRIOBP-209ENST00000428075 NHSL1Q5SYE7 1610 aa41.44■■■■■ 4.22
TRIOBP-209ENST00000428075 SHPRHQ149N8 1683 aa41.42■■■■■ 4.22
TRIOBP-209ENST00000428075 C1orf167Q5SNV9 1468 aa41.42■■■■■ 4.22
TRIOBP-209ENST00000428075 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa41.42■■■■■ 4.22
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
TRIOBP-209ENST00000428075 PIK3C2GO75747 1445 aa41.4■■■■■ 4.22
TRIOBP-209ENST00000428075 TECPR2O15040 1411 aa41.35■■■■■ 4.21
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.34■■■■■ 4.21
TRIOBP-209ENST00000428075 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
TRIOBP-209ENST00000428075 STK26Q9P289 416 aa41.33■■■■■ 4.21
TRIOBP-209ENST00000428075 ORAI2Q96SN7 254 aa41.32■■■■■ 4.21
TRIOBP-209ENST00000428075 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.3■■■■■ 4.2
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC11Q96J66 1382 aa41.29■■■■■ 4.2
TRIOBP-209ENST00000428075 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.29■■■■■ 4.2
TRIOBP-209ENST00000428075 LAMC1P11047 1609 aa41.26■■■■■ 4.2
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
TRIOBP-209ENST00000428075 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.25■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
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