RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426266.5

FAM3A-210, Transcript of family with sequence similarity 3 member A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM3A, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3A-210ENST00000426266 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.8■■■□□ 2.36
FAM3A-210ENST00000426266 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
FAM3A-210ENST00000426266 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
FAM3A-210ENST00000426266 FOXD1Q16676 465 aa29.78■■■□□ 2.36
FAM3A-210ENST00000426266 CPS1P31327 1500 aa29.77■■■□□ 2.36
FAM3A-210ENST00000426266 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.77■■■□□ 2.36
FAM3A-210ENST00000426266 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 KIF1BO60333 1816 aa29.75■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.75■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 BCANQ96GW7 911 aa29.74■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.74■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.72■■■□□ 2.35
FAM3A-210ENST00000426266 HRCP23327 699 aa29.63■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 KCNA6P17658 529 aa29.6■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.6■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 TBX22Q9Y458 520 aa29.58■■■□□ 2.33
FAM3A-210ENST00000426266 DIP2AQ14689 1571 aa29.57■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.57■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 NWD1Q149M9 1564 aa29.56■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.55■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.54■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.52■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 PPLO60437 1756 aa29.52■■■□□ 2.32
FAM3A-210ENST00000426266 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.5■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 RGL3Q3MIN7 710 aa29.48■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 PIK3R4Q99570 1358 aa29.48■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 TOM1O60784 492 aa29.47■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 TMEM94Q12767 1356 aa29.47■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.45■■■□□ 2.31
FAM3A-210ENST00000426266 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 PTPRUQ92729 1446 aa29.43■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 ALKQ9UM73 1620 aa29.42■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 IFT172Q9UG01 1749 aa29.42■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 PIP4K2BP78356 416 aa29.41■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 METP08581 1390 aa29.4■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.4■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
FAM3A-210ENST00000426266 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
FAM3A-210ENST00000426266 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
FAM3A-210ENST00000426266 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.36■■■□□ 2.29
FAM3A-210ENST00000426266 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
FAM3A-210ENST00000426266 MSH6P52701 1360 aa29.3■■■□□ 2.28
FAM3A-210ENST00000426266 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.29■■■□□ 2.28
FAM3A-210ENST00000426266 C14orf37Q86TY3 774 aa29.28■■■□□ 2.28
FAM3A-210ENST00000426266 PIK3C2GO75747 1445 aa29.27■■■□□ 2.28
FAM3A-210ENST00000426266 MYOM2P54296 1465 aa29.26■■■□□ 2.27
FAM3A-210ENST00000426266 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.23■■■□□ 2.27
FAM3A-210ENST00000426266 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
FAM3A-210ENST00000426266 HSPA1LP34931 641 aa29.21■■■□□ 2.27
FAM3A-210ENST00000426266 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.2■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 PTCH1Q13635 1447 aa29.19■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.17■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.17■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.17■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.16■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.16■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.16■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 ATF3P18847 181 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 SLAIN2Q9P270 581 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 LAMC1P11047 1609 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM3A-210ENST00000426266 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.13■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 STK26Q9P289 416 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 DCCP43146 1447 aa29.11■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 STAC3Q96MF2 364 aa29.1■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.08■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 TECPR2O15040 1411 aa29.08■■■□□ 2.25
FAM3A-210ENST00000426266 ABCC11Q96J66 1382 aa29.07■■■□□ 2.24
FAM3A-210ENST00000426266 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.04■■■□□ 2.24
FAM3A-210ENST00000426266 MST1RQ04912 1400 aa29.02■■■□□ 2.24
FAM3A-210ENST00000426266 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.01■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 ADGRB1O14514 1584 aa29■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 NEUROD1Q13562 356 aa28.99■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.99■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 PHLPP1O60346 1717 aa28.97■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 BRINP3Q76B58 766 aa28.96■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 SIRT1Q96EB6 747 aa28.96■■■□□ 2.23
FAM3A-210ENST00000426266 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.93■■■□□ 2.22
FAM3A-210ENST00000426266 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.93■■■□□ 2.22
FAM3A-210ENST00000426266 DLC1Q96QB1 1528 aa28.93■■■□□ 2.22
FAM3A-210ENST00000426266 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms