RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZFYVE9O95405 1425 aa26.41■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HSPA1LP34931 641 aa26.4■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PIP4K2BP78356 416 aa26.39■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLTCL1P53675 1640 aa26.39■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TOM1O60784 492 aa26.38■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CPS1P31327 1500 aa26.37■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.37■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF1BO60333 1816 aa26.35■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.34■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.33■■□□□ 1.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.31■■□□□ 1.8
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.3■■□□□ 1.8
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HRCP23327 699 aa26.25■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FOXD1Q16676 465 aa26.24■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.23■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DIP2AQ14689 1571 aa26.21■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.21■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NWD1Q149M9 1564 aa26.2■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.2■■□□□ 1.79
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.19■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.18■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.17■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BCANQ96GW7 911 aa26.17■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TBX22Q9Y458 520 aa26.17■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.17■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCNA6P17658 529 aa26.16■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PPLO60437 1756 aa26.15■■□□□ 1.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.13■■□□□ 1.77
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.12■■□□□ 1.77
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PIK3R4Q99570 1358 aa26.11■■□□□ 1.77
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IFT172Q9UG01 1749 aa26.08■■□□□ 1.77
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ALKQ9UM73 1620 aa26.06■■□□□ 1.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.05■■□□□ 1.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM94Q12767 1356 aa26.03■■□□□ 1.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTPRUQ92729 1446 aa26.01■■□□□ 1.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 METP08581 1390 aa25.97■■□□□ 1.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RGL3Q3MIN7 710 aa25.97■■□□□ 1.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.97■■□□□ 1.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.95■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.92■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYOM2P54296 1465 aa25.91■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PIK3C2GO75747 1445 aa25.89■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.89■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MSH6P52701 1360 aa25.89■■□□□ 1.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.89■■□□□ 1.73
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTCH1Q13635 1447 aa25.84■■□□□ 1.73
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LAMC1P11047 1609 aa25.84■■□□□ 1.73
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.82■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.81■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.81■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C14orf37Q86TY3 774 aa25.79■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.79■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DCCP43146 1447 aa25.79■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.78■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STAC3Q96MF2 364 aa25.78■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TECPR2O15040 1411 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 POTEAQ6S8J7 498 aa25.75■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.75■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLAIN2Q9P270 581 aa25.74■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCC11Q96J66 1382 aa25.73■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.73■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATF3P18847 181 aa25.72■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.71■■□□□ 1.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.7■■□□□ 1.7
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.68■■□□□ 1.7
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADGRB1O14514 1584 aa25.68■■□□□ 1.7
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MST1RQ04912 1400 aa25.67■■□□□ 1.7
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STK26Q9P289 416 aa25.66■■□□□ 1.7
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SIRT1Q96EB6 747 aa25.65■■□□□ 1.7
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.63■■□□□ 1.69
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DLC1Q96QB1 1528 aa25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms