RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 FOXD1Q16676 465 aa36.35■■■■□ 3.41
PTPA-210ENST00000414510 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PTPA-210ENST00000414510 CPS1P31327 1500 aa36.34■■■■□ 3.41
PTPA-210ENST00000414510 KIF1BO60333 1816 aa36.33■■■■□ 3.41
PTPA-210ENST00000414510 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.31■■■■□ 3.4
PTPA-210ENST00000414510 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
PTPA-210ENST00000414510 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPA-210ENST00000414510 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
PTPA-210ENST00000414510 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.27■■■■□ 3.4
PTPA-210ENST00000414510 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPA-210ENST00000414510 BCANQ96GW7 911 aa36.22■■■■□ 3.39
PTPA-210ENST00000414510 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.21■■■■□ 3.39
PTPA-210ENST00000414510 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.2■■■■□ 3.39
PTPA-210ENST00000414510 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
PTPA-210ENST00000414510 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
PTPA-210ENST00000414510 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.18■■■■□ 3.38
PTPA-210ENST00000414510 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
PTPA-210ENST00000414510 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPA-210ENST00000414510 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPA-210ENST00000414510 NWD1Q149M9 1564 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPA-210ENST00000414510 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.13■■■■□ 3.37
PTPA-210ENST00000414510 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
PTPA-210ENST00000414510 DIP2AQ14689 1571 aa36.1■■■■□ 3.37
PTPA-210ENST00000414510 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PTPA-210ENST00000414510 PPLO60437 1756 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPA-210ENST00000414510 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.07■■■■□ 3.37
PTPA-210ENST00000414510 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPA-210ENST00000414510 KCNA6P17658 529 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPA-210ENST00000414510 HRCP23327 699 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPA-210ENST00000414510 TBX22Q9Y458 520 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPA-210ENST00000414510 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPA-210ENST00000414510 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
PTPA-210ENST00000414510 ALKQ9UM73 1620 aa36.01■■■■□ 3.35
PTPA-210ENST00000414510 IFT172Q9UG01 1749 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPA-210ENST00000414510 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PTPA-210ENST00000414510 TMEM94Q12767 1356 aa35.95■■■■□ 3.35
PTPA-210ENST00000414510 PTPRUQ92729 1446 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 RGL3Q3MIN7 710 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 PIK3R4Q99570 1358 aa35.91■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.91■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 METP08581 1390 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
PTPA-210ENST00000414510 TOM1O60784 492 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPA-210ENST00000414510 PIP4K2BP78356 416 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPA-210ENST00000414510 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
PTPA-210ENST00000414510 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPA-210ENST00000414510 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPA-210ENST00000414510 MSH6P52701 1360 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPA-210ENST00000414510 PIK3C2GO75747 1445 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPA-210ENST00000414510 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
PTPA-210ENST00000414510 MYOM2P54296 1465 aa35.71■■■■□ 3.31
PTPA-210ENST00000414510 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
PTPA-210ENST00000414510 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPA-210ENST00000414510 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPA-210ENST00000414510 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPA-210ENST00000414510 C14orf37Q86TY3 774 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPA-210ENST00000414510 HSPA1LP34931 641 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPA-210ENST00000414510 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.63■■■■□ 3.29
PTPA-210ENST00000414510 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPA-210ENST00000414510 PTCH1Q13635 1447 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPA-210ENST00000414510 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPA-210ENST00000414510 LAMC1P11047 1609 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPA-210ENST00000414510 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.59■■■■□ 3.29
PTPA-210ENST00000414510 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.54■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.54■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 SLAIN2Q9P270 581 aa35.51■■■■□ 3.28
PTPA-210ENST00000414510 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 DCCP43146 1447 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 ATF3P18847 181 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 STK26Q9P289 416 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 TECPR2O15040 1411 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.48■■■■□ 3.27
PTPA-210ENST00000414510 ADGRB1O14514 1584 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPA-210ENST00000414510 MST1RQ04912 1400 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPA-210ENST00000414510 ABCC11Q96J66 1382 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPA-210ENST00000414510 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPA-210ENST00000414510 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.41■■■■□ 3.26
PTPA-210ENST00000414510 PHLPP1O60346 1717 aa35.41■■■■□ 3.26
PTPA-210ENST00000414510 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPA-210ENST00000414510 STAC3Q96MF2 364 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPA-210ENST00000414510 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPA-210ENST00000414510 NEUROD1Q13562 356 aa35.33■■■■□ 3.25
PTPA-210ENST00000414510 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
PTPA-210ENST00000414510 BRINP3Q76B58 766 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPA-210ENST00000414510 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PTPA-210ENST00000414510 DLC1Q96QB1 1528 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPA-210ENST00000414510 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms