RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 PIP4K2BP78356 416 aa29.5■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.5■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 HFM1A2PYH4 1435 aa29.49■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.49■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 ZFYVE9O95405 1425 aa29.45■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.45■■■□□ 2.31
ANKRD54-204ENST00000411961 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.43■■■□□ 2.3
ANKRD54-204ENST00000411961 KCNA6P17658 529 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-204ENST00000411961 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-204ENST00000411961 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ANKRD54-204ENST00000411961 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
ANKRD54-204ENST00000411961 TBX22Q9Y458 520 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKRD54-204ENST00000411961 TRPM2O94759 1503 aa29.31■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 TMEM94Q12767 1356 aa29.3■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 HSPA1LP34931 641 aa29.3■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 CLTCL1P53675 1640 aa29.29■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 KIF1BO60333 1816 aa29.29■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.27■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 NWD1Q149M9 1564 aa29.27■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 ALKQ9UM73 1620 aa29.27■■■□□ 2.28
ANKRD54-204ENST00000411961 DIP2AQ14689 1571 aa29.25■■■□□ 2.27
ANKRD54-204ENST00000411961 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.23■■■□□ 2.27
ANKRD54-204ENST00000411961 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-204ENST00000411961 PIK3R4Q99570 1358 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-204ENST00000411961 MSH6P52701 1360 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 FOXD1Q16676 465 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 C14orf37Q86TY3 774 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ANKRD54-204ENST00000411961 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.13■■■□□ 2.25
ANKRD54-204ENST00000411961 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD54-204ENST00000411961 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD54-204ENST00000411961 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.1■■■□□ 2.25
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.1■■■□□ 2.25
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD54-204ENST00000411961 PTPRUQ92729 1446 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 SLAIN2Q9P270 581 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 METP08581 1390 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 ATF3P18847 181 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 RGL3Q3MIN7 710 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD54-204ENST00000411961 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-204ENST00000411961 PPLO60437 1756 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-204ENST00000411961 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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ANKRD54-204ENST00000411961 ILDR2Q71H61 639 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-204ENST00000411961 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-204ENST00000411961 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-204ENST00000411961 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD54-204ENST00000411961 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD54-204ENST00000411961 PHLPP1O60346 1717 aa28.89■■■□□ 2.21
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ANKRD54-204ENST00000411961 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ANKRD54-204ENST00000411961 DCCP43146 1447 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD54-204ENST00000411961 IFT172Q9UG01 1749 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD54-204ENST00000411961 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD54-204ENST00000411961 PTCH1Q13635 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 BRINP3Q76B58 766 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 STK26Q9P289 416 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 MST1RQ04912 1400 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 JCADQ9P266 1359 aa28.76■■■□□ 2.2
ANKRD54-204ENST00000411961 PIK3C2GO75747 1445 aa28.75■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 SOCS7O14512 581 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-204ENST00000411961 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 MYOM2P54296 1465 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCC11Q96J66 1382 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 LAMC1P11047 1609 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 TECPR2O15040 1411 aa28.64■■■□□ 2.18
ANKRD54-204ENST00000411961 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.62■■■□□ 2.17
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