RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 CHGAP10645 457 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
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ANKRD54-203ENST00000407117 ALKQ9UM73 1620 aa42.01■■■■■ 4.32
ANKRD54-203ENST00000407117 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNA6P17658 529 aa42■■■■■ 4.31
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42■■■■■ 4.31
ANKRD54-203ENST00000407117 BCANQ96GW7 911 aa41.98■■■■■ 4.31
ANKRD54-203ENST00000407117 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.97■■■■■ 4.31
ANKRD54-203ENST00000407117 HFM1A2PYH4 1435 aa41.96■■■■■ 4.31
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA1LP34931 641 aa41.93■■■■■ 4.3
ANKRD54-203ENST00000407117 NWD1Q149M9 1564 aa41.9■■■■■ 4.3
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ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM94Q12767 1356 aa41.88■■■■■ 4.29
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ANKRD54-203ENST00000407117 TBX22Q9Y458 520 aa41.85■■■■■ 4.29
ANKRD54-203ENST00000407117 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
ANKRD54-203ENST00000407117 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
ANKRD54-203ENST00000407117 DIP2AQ14689 1571 aa41.79■■■■■ 4.28
ANKRD54-203ENST00000407117 TRPM2O94759 1503 aa41.78■■■■■ 4.28
ANKRD54-203ENST00000407117 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.78■■■■■ 4.28
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM52Q96A61 297 aa41.77■■■■■ 4.28
ANKRD54-203ENST00000407117 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
ANKRD54-203ENST00000407117 PIK3R4Q99570 1358 aa41.74■■■■■ 4.27
ANKRD54-203ENST00000407117 CLTCL1P53675 1640 aa41.69■■■■■ 4.27
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
ANKRD54-203ENST00000407117 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.67■■■■■ 4.26
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ANKRD54-203ENST00000407117 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.64■■■■■ 4.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ILDR2Q71H61 639 aa41.61■■■■■ 4.25
ANKRD54-203ENST00000407117 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.61■■■■■ 4.25
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF1BO60333 1816 aa41.57■■■■■ 4.24
ANKRD54-203ENST00000407117 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
ANKRD54-203ENST00000407117 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.56■■■■■ 4.24
ANKRD54-203ENST00000407117 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.55■■■■■ 4.24
ANKRD54-203ENST00000407117 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.52■■■■■ 4.24
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPRUQ92729 1446 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SLAIN2Q9P270 581 aa41.48■■■■■ 4.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.48■■■■■ 4.23
ANKRD54-203ENST00000407117 C14orf37Q86TY3 774 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKRD54-203ENST00000407117 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.45■■■■■ 4.23
ANKRD54-203ENST00000407117 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
ANKRD54-203ENST00000407117 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.44■■■■■ 4.22
ANKRD54-203ENST00000407117 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
ANKRD54-203ENST00000407117 METP08581 1390 aa41.41■■■■■ 4.22
ANKRD54-203ENST00000407117 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.41■■■■■ 4.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.4■■■■■ 4.22
ANKRD54-203ENST00000407117 FOXD1Q16676 465 aa41.38■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.36■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.36■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 ATF3P18847 181 aa41.36■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 SOCS7O14512 581 aa41.35■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 DCCP43146 1447 aa41.33■■■■■ 4.21
ANKRD54-203ENST00000407117 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
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ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.23■■■■■ 4.19
ANKRD54-203ENST00000407117 PHLPP1O60346 1717 aa41.21■■■■■ 4.19
ANKRD54-203ENST00000407117 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
ANKRD54-203ENST00000407117 PTCH1Q13635 1447 aa41.19■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.19■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.19■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.18■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.17■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 JCADQ9P266 1359 aa41.15■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 RGL3Q3MIN7 710 aa41.14■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
ANKRD54-203ENST00000407117 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
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ANKRD54-203ENST00000407117 BRINP3Q76B58 766 aa41.11■■■■■ 4.17
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.1■■■■■ 4.17
ANKRD54-203ENST00000407117 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.09■■■■■ 4.17
ANKRD54-203ENST00000407117 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.07■■■■■ 4.16
ANKRD54-203ENST00000407117 IFT172Q9UG01 1749 aa41.06■■■■■ 4.16
ANKRD54-203ENST00000407117 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.03■■■■■ 4.16
ANKRD54-203ENST00000407117 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
ANKRD54-203ENST00000407117 HRCP23327 699 aa41■■■■■ 4.15
ANKRD54-203ENST00000407117 PIK3C2GO75747 1445 aa40.99■■■■■ 4.15
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.98■■■■■ 4.15
ANKRD54-203ENST00000407117 TECPR2O15040 1411 aa40.93■■■■■ 4.14
ANKRD54-203ENST00000407117 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.92■■■■■ 4.14
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ANKRD54-203ENST00000407117 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.91■■■■■ 4.14
ANKRD54-203ENST00000407117 SHPRHQ149N8 1683 aa40.91■■■■■ 4.14
ANKRD54-203ENST00000407117 MYOM2P54296 1465 aa40.9■■■■■ 4.14
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCC11Q96J66 1382 aa40.88■■■■■ 4.14
ANKRD54-203ENST00000407117 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.88■■■■■ 4.13
ANKRD54-203ENST00000407117 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
ANKRD54-203ENST00000407117 STK26Q9P289 416 aa40.84■■■■■ 4.13
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.83■■■■■ 4.13
ANKRD54-203ENST00000407117 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
ANKRD54-203ENST00000407117 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.82■■■■■ 4.13
ANKRD54-203ENST00000407117 LRP6O75581 1613 aa40.82■■■■■ 4.12
ANKRD54-203ENST00000407117 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.81■■■■■ 4.12
ANKRD54-203ENST00000407117 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
ANKRD54-203ENST00000407117 POTEAQ6S8J7 498 aa40.79■■■■■ 4.12
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