RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.64■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.63■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.62■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.61■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 E9PCH4 1651 aa20.61■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.59■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 ROCK1Q13464 1354 aa20.59■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.58■□□□□ 0.89
CNGA3-202ENST00000393503 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.56■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.56■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 BCANQ96GW7 911 aa20.52■□□□□ 0.88
CNGA3-202ENST00000393503 ITGAEP38570 1179 aa20.5■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 TBX22Q9Y458 520 aa20.5■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 NUP155O75694 1391 aa20.49■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 MSH6P52701 1360 aa20.48■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 PTPRUQ92729 1446 aa20.48■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 SLAIN2Q9P270 581 aa20.48■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 POTEAQ6S8J7 498 aa20.47■□□□□ 0.87
CNGA3-202ENST00000393503 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.44■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 DIP2AQ14689 1571 aa20.42■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 PHLPP1O60346 1717 aa20.42■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.41■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CNGA3-202ENST00000393503 PIK3R4Q99570 1358 aa20.39■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 LRP6O75581 1613 aa20.38■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.38■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.38■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.37■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 TRPM2O94759 1503 aa20.37■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 METP08581 1390 aa20.36■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 JCADQ9P266 1359 aa20.36■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 CLTCL1P53675 1640 aa20.35■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.35■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 NAIPQ13075 1403 aa20.34■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 C14orf37Q86TY3 774 aa20.33■□□□□ 0.85
CNGA3-202ENST00000393503 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.32■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 BRINP3Q76B58 766 aa20.31■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.31■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 MST1RQ04912 1400 aa20.28■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 ATF3P18847 181 aa20.28■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CNGA3-202ENST00000393503 DCCP43146 1447 aa20.27■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.26■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 SHPRHQ149N8 1683 aa20.26■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.24■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.22■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.22■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 HFM1A2PYH4 1435 aa20.21■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.21■□□□□ 0.83
CNGA3-202ENST00000393503 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.19■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.19■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 KIF1BO60333 1816 aa20.18■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 FOXD1Q16676 465 aa20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 PTCH1Q13635 1447 aa20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-202ENST00000393503 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.14■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM52Q96A61 297 aa20.14■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.13■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.13■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 PPLO60437 1756 aa20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 LAMC1P11047 1609 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 ORAI2Q96SN7 254 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 AFF2P51816 1311 aa20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CNGA3-202ENST00000393503 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 RXRBP28702 533 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 C8orf37Q96NL8 207 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CNGA3-202ENST00000393503 RGS12O14924 1447 aa20.02■□□□□ 0.79
CNGA3-202ENST00000393503 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20■□□□□ 0.79
CNGA3-202ENST00000393503 IFT172Q9UG01 1749 aa19.99■□□□□ 0.79
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS2O95450 1211 aa19.99■□□□□ 0.79
CNGA3-202ENST00000393503 RGL3Q3MIN7 710 aa19.99■□□□□ 0.79
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