RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZFYVE9O95405 1425 aa11.73□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 ALKQ9UM73 1620 aa11.73□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.73□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 KCNA6P17658 529 aa11.72□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 HSPA1LP34931 641 aa11.72□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRIM52Q96A61 297 aa11.71□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.71□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.7□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.7□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 HFM1A2PYH4 1435 aa11.69□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM94Q12767 1356 aa11.68□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 TBX22Q9Y458 520 aa11.67□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.66□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 NWD1Q149M9 1564 aa11.66□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 CLTCL1P53675 1640 aa11.65□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIF1BO60333 1816 aa11.65□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 ILDR2Q71H61 639 aa11.64□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRPM2O94759 1503 aa11.64□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 FOXD1Q16676 465 aa11.63□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.61□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 DIP2AQ14689 1571 aa11.61□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 MSH6P52701 1360 aa11.6□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 PIK3R4Q99570 1358 aa11.6□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.6□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.6□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.6□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 PTPRUQ92729 1446 aa11.6□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 C14orf37Q86TY3 774 aa11.59□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.59□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLAIN2Q9P270 581 aa11.59□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.59□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.58□□□□□ -0.55
RNA5SP18-201ENST00000390935 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 METP08581 1390 aa11.57□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.56□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.56□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.56□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 PPLO60437 1756 aa11.55□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.55□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATF3P18847 181 aa11.54□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 RGL3Q3MIN7 710 aa11.54□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.53□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.53□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.53□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
RNA5SP18-201ENST00000390935 PHLPP1O60346 1717 aa11.52□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 SOCS7O14512 581 aa11.51□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.51□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.5□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 IFT172Q9UG01 1749 aa11.49□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.48□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.48□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 DCCP43146 1447 aa11.47□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.47□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 BRINP3Q76B58 766 aa11.47□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 MST1RQ04912 1400 aa11.46□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.46□□□□□ -0.57
RNA5SP18-201ENST00000390935 PTCH1Q13635 1447 aa11.45□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 JCADQ9P266 1359 aa11.45□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.45□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 STK26Q9P289 416 aa11.45□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 HRCP23327 699 aa11.43□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.43□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 PIK3C2GO75747 1445 aa11.43□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.43□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.42□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 POTEAQ6S8J7 498 aa11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 ORAI2Q96SN7 254 aa11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 SHPRHQ149N8 1683 aa11.4□□□□□ -0.58
RNA5SP18-201ENST00000390935 ABCC11Q96J66 1382 aa11.4□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.4□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.39□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.39□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRP6O75581 1613 aa11.39□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 TECPR2O15040 1411 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms