RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 IQGAP1P46940 1657 aa18.55■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 MED14O60244 1454 aa18.54■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 HRCP23327 699 aa18.53■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 EID1Q9Y6B2 187 aa18.53■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 KIF1BO60333 1816 aa18.53■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 ZFYVE9O95405 1425 aa18.52■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.52■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNMD-201ENST00000377962 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.47■□□□□ 0.55
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CNMD-201ENST00000377962 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.46■□□□□ 0.55
CNMD-201ENST00000377962 BCANQ96GW7 911 aa18.46■□□□□ 0.55
CNMD-201ENST00000377962 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.46■□□□□ 0.55
CNMD-201ENST00000377962 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.45■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.43■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 RGL3Q3MIN7 710 aa18.43■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.43■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 CERKQ8TCT0 537 aa18.42■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.42■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.4■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 PPLO60437 1756 aa18.4■□□□□ 0.54
CNMD-201ENST00000377962 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.37■□□□□ 0.53
CNMD-201ENST00000377962 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.37■□□□□ 0.53
CNMD-201ENST00000377962 IFT172Q9UG01 1749 aa18.35■□□□□ 0.53
CNMD-201ENST00000377962 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.34■□□□□ 0.53
CNMD-201ENST00000377962 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.33■□□□□ 0.53
CNMD-201ENST00000377962 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.33■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 TBX22Q9Y458 520 aa18.32■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 CPS1P31327 1500 aa18.32■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 KCNA6P17658 529 aa18.31■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.31■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.3■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 DIP2AQ14689 1571 aa18.3■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 METP08581 1390 aa18.29■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 PTPRUQ92729 1446 aa18.29■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 NWD1Q149M9 1564 aa18.28■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 ALKQ9UM73 1620 aa18.27■□□□□ 0.52
CNMD-201ENST00000377962 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 FBXO41Q8TF61 875 aa18.25■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.25■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 NEUROD1Q13562 356 aa18.24■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.24■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.24■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.24■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 TMEM94Q12767 1356 aa18.23■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 PIK3C2GO75747 1445 aa18.22■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 PIK3R4Q99570 1358 aa18.22■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 MYOM2P54296 1465 aa18.21■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.21■□□□□ 0.51
CNMD-201ENST00000377962 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.2■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.2■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.2■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.19■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 STK26Q9P289 416 aa18.16■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.15■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 PIP4K2BP78356 416 aa18.15■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.14■□□□□ 0.5
CNMD-201ENST00000377962 C14orf37Q86TY3 774 aa18.13■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 LAMC1P11047 1609 aa18.12■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 TOM1O60784 492 aa18.12■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.11■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 MSH6P52701 1360 aa18.1■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.09■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 ADGRB1O14514 1584 aa18.09■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.08■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 STAC3Q96MF2 364 aa18.08■□□□□ 0.49
CNMD-201ENST00000377962 PTCH1Q13635 1447 aa18.08■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.08■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.07■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.07■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.07■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.06■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 ABCC11Q96J66 1382 aa18.06■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.06■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 TECPR2O15040 1411 aa18.04■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.04■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.03■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 SLAIN2Q9P270 581 aa18.03■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 TONSLQ96HA7 1378 aa18.03■□□□□ 0.48
CNMD-201ENST00000377962 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms