RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 PIP4K2BP78356 416 aa25.83■■□□□ 1.73
USP11-202ENST00000377078 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.82■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 ZFYVE9O95405 1425 aa25.81■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.81■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.8■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.79■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 KCNA6P17658 529 aa25.78■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 TRIM52Q96A61 297 aa25.78■■□□□ 1.72
USP11-202ENST00000377078 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.77■■□□□ 1.72
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USP11-202ENST00000377078 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
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USP11-202ENST00000377078 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.69■■□□□ 1.7
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USP11-202ENST00000377078 TBX22Q9Y458 520 aa25.69■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 TMEM94Q12767 1356 aa25.69■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 NWD1Q149M9 1564 aa25.68■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 TRPM2O94759 1503 aa25.68■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 HSPA1LP34931 641 aa25.67■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 DIP2AQ14689 1571 aa25.66■■□□□ 1.7
USP11-202ENST00000377078 ALKQ9UM73 1620 aa25.65■■□□□ 1.7
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USP11-202ENST00000377078 CLTCL1P53675 1640 aa25.62■■□□□ 1.69
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USP11-202ENST00000377078 C14orf37Q86TY3 774 aa25.55■■□□□ 1.68
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USP11-202ENST00000377078 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.54■■□□□ 1.68
USP11-202ENST00000377078 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.53■■□□□ 1.68
USP11-202ENST00000377078 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.52■■□□□ 1.68
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USP11-202ENST00000377078 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.51■■□□□ 1.67
USP11-202ENST00000377078 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.51■■□□□ 1.67
USP11-202ENST00000377078 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.5■■□□□ 1.67
USP11-202ENST00000377078 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.48■■□□□ 1.67
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USP11-202ENST00000377078 ATF3P18847 181 aa25.45■■□□□ 1.66
USP11-202ENST00000377078 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.45■■□□□ 1.66
USP11-202ENST00000377078 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.44■■□□□ 1.66
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USP11-202ENST00000377078 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
USP11-202ENST00000377078 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
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USP11-202ENST00000377078 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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USP11-202ENST00000377078 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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USP11-202ENST00000377078 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.33■■□□□ 1.65
USP11-202ENST00000377078 PTCH1Q13635 1447 aa25.29■■□□□ 1.64
USP11-202ENST00000377078 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.29■■□□□ 1.64
USP11-202ENST00000377078 PHLPP1O60346 1717 aa25.28■■□□□ 1.64
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USP11-202ENST00000377078 SOCS7O14512 581 aa25.25■■□□□ 1.63
USP11-202ENST00000377078 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.25■■□□□ 1.63
USP11-202ENST00000377078 JCADQ9P266 1359 aa25.25■■□□□ 1.63
USP11-202ENST00000377078 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.24■■□□□ 1.63
USP11-202ENST00000377078 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.22■■□□□ 1.63
USP11-202ENST00000377078 BRINP3Q76B58 766 aa25.22■■□□□ 1.63
USP11-202ENST00000377078 IFT172Q9UG01 1749 aa25.22■■□□□ 1.63
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USP11-202ENST00000377078 PIK3C2GO75747 1445 aa25.19■■□□□ 1.62
USP11-202ENST00000377078 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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USP11-202ENST00000377078 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.14■■□□□ 1.62
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USP11-202ENST00000377078 ABCC11Q96J66 1382 aa25.12■■□□□ 1.61
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USP11-202ENST00000377078 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
USP11-202ENST00000377078 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
USP11-202ENST00000377078 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.08■■□□□ 1.6
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USP11-202ENST00000377078 SHPRHQ149N8 1683 aa25.07■■□□□ 1.6
USP11-202ENST00000377078 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.06■■□□□ 1.6
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