RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368780.3

LCE2B-201, Transcript of late cornified envelope 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCE2B, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE2B-201ENST00000368780 TRPM2O94759 1503 aa29■■■□□ 2.23
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LCE2B-201ENST00000368780 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.96■■■□□ 2.23
LCE2B-201ENST00000368780 CLTCL1P53675 1640 aa28.96■■■□□ 2.23
LCE2B-201ENST00000368780 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
LCE2B-201ENST00000368780 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
LCE2B-201ENST00000368780 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.96■■■□□ 2.23
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LCE2B-201ENST00000368780 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.95■■■□□ 2.22
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LCE2B-201ENST00000368780 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.88■■■□□ 2.21
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LCE2B-201ENST00000368780 NWD1Q149M9 1564 aa28.79■■■□□ 2.2
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LCE2B-201ENST00000368780 TBX22Q9Y458 520 aa28.79■■■□□ 2.2
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LCE2B-201ENST00000368780 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.79■■■□□ 2.2
LCE2B-201ENST00000368780 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.78■■■□□ 2.2
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LCE2B-201ENST00000368780 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.72■■■□□ 2.19
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LCE2B-201ENST00000368780 PIK3R4Q99570 1358 aa28.69■■■□□ 2.18
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LCE2B-201ENST00000368780 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.63■■■□□ 2.17
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LCE2B-201ENST00000368780 METP08581 1390 aa28.62■■■□□ 2.17
LCE2B-201ENST00000368780 HRCP23327 699 aa28.62■■■□□ 2.17
LCE2B-201ENST00000368780 PPLO60437 1756 aa28.62■■■□□ 2.17
LCE2B-201ENST00000368780 MSH6P52701 1360 aa28.62■■■□□ 2.17
LCE2B-201ENST00000368780 C14orf37Q86TY3 774 aa28.6■■■□□ 2.17
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LCE2B-201ENST00000368780 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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LCE2B-201ENST00000368780 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.39■■■□□ 2.14
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LCE2B-201ENST00000368780 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.38■■■□□ 2.13
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LCE2B-201ENST00000368780 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.34■■■□□ 2.13
LCE2B-201ENST00000368780 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.34■■■□□ 2.13
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LCE2B-201ENST00000368780 STAC3Q96MF2 364 aa28.2■■■□□ 2.1
LCE2B-201ENST00000368780 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.2■■■□□ 2.1
LCE2B-201ENST00000368780 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
LCE2B-201ENST00000368780 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
LCE2B-201ENST00000368780 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.18■■■□□ 2.1
LCE2B-201ENST00000368780 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.17■■■□□ 2.1
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LCE2B-201ENST00000368780 JCADQ9P266 1359 aa28.13■■■□□ 2.09
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