RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SH3BP5-201ENST00000366391 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SH3BP5-201ENST00000366391 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP5-201ENST00000366391 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 NWD1Q149M9 1564 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5-201ENST00000366391 BCANQ96GW7 911 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 DIP2AQ14689 1571 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 PPLO60437 1756 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 FOXD1Q16676 465 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 ALKQ9UM73 1620 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNA6P17658 529 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TBX22Q9Y458 520 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 IFT172Q9UG01 1749 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TOM1O60784 492 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PIK3R4Q99570 1358 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM94Q12767 1356 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5-201ENST00000366391 PIP4K2BP78356 416 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 HRCP23327 699 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPRUQ92729 1446 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-201ENST00000366391 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-201ENST00000366391 METP08581 1390 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-201ENST00000366391 RGL3Q3MIN7 710 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-201ENST00000366391 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-201ENST00000366391 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 MSH6P52701 1360 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 HSPA1LP34931 641 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP5-201ENST00000366391 C14orf37Q86TY3 774 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5-201ENST00000366391 LAMC1P11047 1609 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP5-201ENST00000366391 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP5-201ENST00000366391 PIK3C2GO75747 1445 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP5-201ENST00000366391 MYOM2P54296 1465 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP5-201ENST00000366391 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 PTCH1Q13635 1447 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 PHLPP1O60346 1717 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 SLAIN2Q9P270 581 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 DCCP43146 1447 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 ATF3P18847 181 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-201ENST00000366391 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SH3BP5-201ENST00000366391 TECPR2O15040 1411 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 DISP3Q9P2K9 1392 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 MST1RQ04912 1400 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 STK26Q9P289 416 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 ABCC11Q96J66 1382 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 STAC3Q96MF2 364 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 ADGRB1O14514 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 BRINP3Q76B58 766 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-201ENST00000366391 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms