RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.07■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.07■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 KIF16BQ96L93 1317 aa26.06■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 HMOX1P09601 288 aa26.05■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.05■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 GSE1Q14687 1217 aa26.05■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.03■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 RUNDC1Q96C34 613 aa26.03■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.02■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 AFAP1Q8N556 730 aa26.02■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 GRIN2BQ13224 1484 aa26.02■■□□□ 1.76
SMURF1-201ENST00000361125 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.01■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 TPM4P67936 248 aa26.01■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.01■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.99■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.99■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 NESP48681 1621 aa25.99■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.98■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SMURF1-201ENST00000361125 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 ARID3AQ99856 593 aa25.95■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.95■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 CFTRP13569 1480 aa25.94■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 H3BQV1 296 aa25.94■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 IFFO2Q5TF58 517 aa25.94■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 MSH5O43196 834 aa25.94■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.94■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.92■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.91■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.91■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 MIA2Q96PC5 1412 aa25.91■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 SYNJ2O15056 1496 aa25.91■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 PRXQ9BXM0 1461 aa25.9■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 VPS53Q5VIR6 699 aa25.9■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.9■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SMURF1-201ENST00000361125 KIF3AQ9Y496 699 aa25.88■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 GNAI1P63096 354 aa25.87■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 ATF3P18847 181 aa25.87■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 MARCH6O60337 910 aa25.87■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.87■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 STAC3Q96MF2 364 aa25.86■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 TOP2BQ02880 1626 aa25.86■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 PANK1Q8TE04 598 aa25.86■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 PHF14O94880 888 aa25.85■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 WDR97A6NE52 1622 aa25.85■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.85■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.84■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 MTHFSP49914 203 aa25.84■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 TIAM1Q13009 1591 aa25.83■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 ROCK1Q13464 1354 aa25.83■■□□□ 1.73
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.83■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.83■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 MCTP1Q6DN14 999 aa25.82■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP6P59044 892 aa25.82■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.82■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.82■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 APPP05067 770 aa25.8■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 LNPKQ9C0E8 428 aa25.8■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 REC8O95072 547 aa25.79■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.78■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.78■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 PRAM1Q96QH2 718 aa25.78■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.78■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 RAD21O60216 631 aa25.78■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 PDE4CQ08493 712 aa25.77■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.77■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.77■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.77■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R1AP30153 589 aa25.77■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.77■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 AKNAQ7Z591 1439 aa25.76■■□□□ 1.72
SMURF1-201ENST00000361125 HFM1A2PYH4 1435 aa25.76■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 IFT140Q96RY7 1462 aa25.76■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.76■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.75■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 VPS37DQ86XT2 251 aa25.75■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 TOPBP1Q92547 1522 aa25.75■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.75■■□□□ 1.71
SMURF1-201ENST00000361125 FBXW7Q969H0 707 aa25.75■■□□□ 1.71
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