RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 PRDM2Q13029 1718 aa25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1-201ENST00000360982 APAF1O14727 1248 aa25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1-201ENST00000360982 PDE4AP27815 886 aa25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1-201ENST00000360982 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1-201ENST00000360982 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1-201ENST00000360982 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 RIPK4P57078 832 aa25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 NLRP6P59044 892 aa25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 ST18O60284 1047 aa25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 NCOA2Q15596 1464 aa25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 KIF16BQ96L93 1317 aa25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 TPM4P67936 248 aa25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 GNAI1P63096 354 aa25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 IL27Q8NEV9 243 aa25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 RUNDC1Q96C34 613 aa25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 KIF21BO75037 1637 aa25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC4A3P48751 1232 aa25.33■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.32■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 MARCH6O60337 910 aa25.32■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.32■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 ROCK1Q13464 1354 aa25.31■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.31■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.31■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.31■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 RILPL2Q969X0 211 aa25.3■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 NESP48681 1621 aa25.3■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.29■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.29■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.28■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 HFM1A2PYH4 1435 aa25.28■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 CABP2Q9NPB3 220 aa25.27■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.27■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.27■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 VPS37DQ86XT2 251 aa25.27■■□□□ 1.64
NCKAP1-201ENST00000360982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.26■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.26■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.25■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.25■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 TOPBP1Q92547 1522 aa25.25■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.634e-8■■□□□ 12.1
NCKAP1-201ENST00000360982 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.25■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 ABTB2Q8N961 1025 aa25.25■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 HMGXB3Q12766 1538 aa25.24■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.24■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.24■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 VPS53Q5VIR6 699 aa25.23■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 COG6Q9Y2V7 657 aa25.23■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.22■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.22■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 NECTIN2Q92692 538 aa25.22■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 HMOX1P09601 288 aa25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1-201ENST00000360982 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 REC8O95072 547 aa25.19■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC7Q96M83 1385 aa25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 H3BQV1 296 aa25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 IFFO2Q5TF58 517 aa25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 PRAM1Q96QH2 718 aa25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 TRDNQ13061 729 aa25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 APPP05067 770 aa25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM161AQ3B820 660 aa25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1-201ENST00000360982 RAPGEF3O95398 923 aa25.14■■□□□ 1.61
NCKAP1-201ENST00000360982 NFKBIBQ15653 356 aa25.14■■□□□ 1.61
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