RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 ZFYVE9O95405 1425 aa23.34■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 KCNA6P17658 529 aa23.29■■□□□ 1.32
CTSW-201ENST00000307886 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.28■■□□□ 1.32
CTSW-201ENST00000307886 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CTSW-201ENST00000307886 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.25■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 NAIPQ13075 1403 aa23.25■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 TMEM94Q12767 1356 aa23.23■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 NWD1Q149M9 1564 aa23.21■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CTSW-201ENST00000307886 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 BCANQ96GW7 911 aa23.2■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 TBX22Q9Y458 520 aa23.19■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.18■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.17■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CTSW-201ENST00000307886 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CTSW-201ENST00000307886 HFM1A2PYH4 1435 aa23.13■■□□□ 1.29
CTSW-201ENST00000307886 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.12■■□□□ 1.29
CTSW-201ENST00000307886 CLTCL1P53675 1640 aa23.1■■□□□ 1.29
CTSW-201ENST00000307886 SOCS7O14512 581 aa23.08■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 PTPRUQ92729 1446 aa23.07■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 TRPM2O94759 1503 aa23.07■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 DIP2AQ14689 1571 aa23.07■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.07■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 PIK3R4Q99570 1358 aa23.06■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 TRIM52Q96A61 297 aa23.06■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.04■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 MSH6P52701 1360 aa23.04■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.03■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 SLAIN2Q9P270 581 aa23.03■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.03■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.02■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.02■■□□□ 1.28
CTSW-201ENST00000307886 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 METP08581 1390 aa22.99■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 KIF1BO60333 1816 aa22.98■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 FOXD1Q16676 465 aa22.96■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.96■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTSW-201ENST00000307886 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTSW-201ENST00000307886 C14orf37Q86TY3 774 aa22.91■■□□□ 1.26
CTSW-201ENST00000307886 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.9■■□□□ 1.26
CTSW-201ENST00000307886 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.89■■□□□ 1.26
CTSW-201ENST00000307886 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CTSW-201ENST00000307886 PHLPP1O60346 1717 aa22.89■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 ATF3P18847 181 aa22.87■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.86■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 PPLO60437 1756 aa22.86■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 BRINP3Q76B58 766 aa22.83■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 DCCP43146 1447 aa22.83■■□□□ 1.25
CTSW-201ENST00000307886 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 MST1RQ04912 1400 aa22.81■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.8■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 JCADQ9P266 1359 aa22.8■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.8■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.79■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.79■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.78■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.78■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 RGL3Q3MIN7 710 aa22.78■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 POTEAQ6S8J7 498 aa22.77■■□□□ 1.24
CTSW-201ENST00000307886 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.76■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 PTCH1Q13635 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 IFT172Q9UG01 1749 aa22.75■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.74■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.73■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 LRP6O75581 1613 aa22.73■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.7■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 SHPRHQ149N8 1683 aa22.7■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.7■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.7■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.69■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.66■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 PIK3C2GO75747 1445 aa22.66■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 ORAI2Q96SN7 254 aa22.65■■□□□ 1.22
CTSW-201ENST00000307886 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.63■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 STK26Q9P289 416 aa22.63■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 TECPR2O15040 1411 aa22.63■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 LAMC1P11047 1609 aa22.62■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 ABCC11Q96J66 1382 aa22.61■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.61■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTSW-201ENST00000307886 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.59■■□□□ 1.21
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