RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 MARCH6O60337 910 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 BECN2A8MW95 431 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 TOPBP1Q92547 1522 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC3-201ENST00000291592 TPM1P09493 284 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 PRXQ9BXM0 1461 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 SLC4A3P48751 1232 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 FAM161AQ3B820 660 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 VPS53Q5VIR6 699 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF592Q92610 1267 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 COG3Q96JB2 828 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 PDE4AP27815 886 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 IFT140Q96RY7 1462 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 SYNJ2O15056 1496 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 TPM2P07951 284 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 RILPL2Q969X0 211 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC7Q96M83 1385 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRC3-201ENST00000291592 E9PSI1 815 aa20.39■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 G3V3G9 751 aa20.38■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.38■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 TEX35Q5T0J7 233 aa20.38■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 PLIN1O60240 522 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 APAF1O14727 1248 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 STAC3Q96MF2 364 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 AFAP1Q8N556 730 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 MCTP1Q6DN14 999 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 MIA2Q96PC5 1412 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC3-201ENST00000291592 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.33■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 WWC1Q8IX03 1113 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 HOMER1Q86YM7 354 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 CRBNQ96SW2 442 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 TIAM1Q13009 1591 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 HECW1Q76N89 1606 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.27■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.27■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM29Q14134 588 aa20.27■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 REC8O95072 547 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 BICD2Q8TD16 824 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 COG6Q9Y2V7 657 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 RIPK4P57078 832 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 FBXO3Q9UK99 471 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 RUNDC1Q96C34 613 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 CABP2Q9NPB3 220 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 NGEFQ8N5V2 710 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 RUFY1Q96T51 708 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC3-201ENST00000291592 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms