RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290377.9

TUBBP5-201, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TUBBP5, Length 1,563 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-201ENST00000290377 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.14■■□□□ 1.3
TUBBP5-201ENST00000290377 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.13■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 CPS1P31327 1500 aa23.13■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 TRPM2O94759 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 ZFYVE9O95405 1425 aa23.12■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.1■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.1■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.09■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 CLTCL1P53675 1640 aa23.09■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 FOXD1Q16676 465 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-201ENST00000290377 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-201ENST00000290377 KIF1BO60333 1816 aa23.04■■□□□ 1.28
TUBBP5-201ENST00000290377 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.03■■□□□ 1.28
TUBBP5-201ENST00000290377 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.02■■□□□ 1.28
TUBBP5-201ENST00000290377 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.98■■□□□ 1.27
TUBBP5-201ENST00000290377 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.98■■□□□ 1.27
TUBBP5-201ENST00000290377 KCNA6P17658 529 aa22.98■■□□□ 1.27
TUBBP5-201ENST00000290377 TBX22Q9Y458 520 aa22.97■■□□□ 1.27
TUBBP5-201ENST00000290377 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 TOM1O60784 492 aa22.94■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.94■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 DIP2AQ14689 1571 aa22.93■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.91■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 NWD1Q149M9 1564 aa22.9■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 PIP4K2BP78356 416 aa22.89■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 RGL3Q3MIN7 710 aa22.89■■□□□ 1.26
TUBBP5-201ENST00000290377 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.88■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 TMEM94Q12767 1356 aa22.88■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 PIK3R4Q99570 1358 aa22.88■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.86■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.84■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 PPLO60437 1756 aa22.84■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.83■■□□□ 1.25
TUBBP5-201ENST00000290377 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 METP08581 1390 aa22.8■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.8■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 C14orf37Q86TY3 774 aa22.8■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 PTPRUQ92729 1446 aa22.79■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 MSH6P52701 1360 aa22.79■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 ALKQ9UM73 1620 aa22.78■■□□□ 1.24
TUBBP5-201ENST00000290377 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.76■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.74■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 IFT172Q9UG01 1749 aa22.74■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.72■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 HSPA1LP34931 641 aa22.72■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TUBBP5-201ENST00000290377 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.69■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 ATF3P18847 181 aa22.67■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 PIK3C2GO75747 1445 aa22.67■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.66■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 SLAIN2Q9P270 581 aa22.66■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 MYOM2P54296 1465 aa22.66■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.65■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TUBBP5-201ENST00000290377 PTCH1Q13635 1447 aa22.63■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.63■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.63■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.62■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 STK26Q9P289 416 aa22.62■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.62■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.61■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.61■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 DCCP43146 1447 aa22.6■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.6■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.59■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 STAC3Q96MF2 364 aa22.59■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.58■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 LAMC1P11047 1609 aa22.58■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TUBBP5-201ENST00000290377 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.57■■□□□ 1.2
TUBBP5-201ENST00000290377 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.56■■□□□ 1.2
TUBBP5-201ENST00000290377 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TUBBP5-201ENST00000290377 ABCC11Q96J66 1382 aa22.54■■□□□ 1.2
TUBBP5-201ENST00000290377 TECPR2O15040 1411 aa22.53■■□□□ 1.2
TUBBP5-201ENST00000290377 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.52■■□□□ 1.2
TUBBP5-201ENST00000290377 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.52■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.51■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.51■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 MST1RQ04912 1400 aa22.5■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 BRINP3Q76B58 766 aa22.49■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 NEUROD1Q13562 356 aa22.48■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.48■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 PHLPP1O60346 1717 aa22.48■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.47■■□□□ 1.19
TUBBP5-201ENST00000290377 SIRT1Q96EB6 747 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.5 ms