RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 IDI1Q13907 227 aa23.57■■□□□ 1.36
FBXO4-201ENST00000281623 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.55■■□□□ 1.36
FBXO4-201ENST00000281623 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
FBXO4-201ENST00000281623 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.53■■□□□ 1.36
FBXO4-201ENST00000281623 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
FBXO4-201ENST00000281623 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.52■■□□□ 1.36
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.51■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.5■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.5■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.48■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 SLIT1O75093 1534 aa23.48■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 USP47Q96K76 1375 aa23.47■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 RGL3Q3MIN7 710 aa23.46■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.46■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.45■■□□□ 1.35
FBXO4-201ENST00000281623 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.43■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.43■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 LAMC1P11047 1609 aa23.42■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC7Q96M83 1385 aa23.41■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.4■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.39■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
FBXO4-201ENST00000281623 LTKP29376 864 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 ZFYVE9O95405 1425 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 PPLO60437 1756 aa23.37■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 IQGAP1P46940 1657 aa23.37■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.37■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 EID1Q9Y6B2 187 aa23.36■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 IFT172Q9UG01 1749 aa23.36■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 MED14O60244 1454 aa23.36■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.35■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 STAC3Q96MF2 364 aa23.35■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.34■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.33■■□□□ 1.33
FBXO4-201ENST00000281623 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.32■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 MYOM2P54296 1465 aa23.31■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.29■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.29■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.27■■□□□ 1.32
FBXO4-201ENST00000281623 ANP32CO43423 234 aa23.26■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.26■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.25■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.24■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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FBXO4-201ENST00000281623 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.23■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.22■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 DIP2AQ14689 1571 aa23.21■■□□□ 1.31
FBXO4-201ENST00000281623 CCER2I3L3R5 266 aa23.2■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 BCANQ96GW7 911 aa23.19■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.19■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.18■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.18■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.15■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.15■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
FBXO4-201ENST00000281623 TESK2Q96S53 571 aa23.13■■□□□ 1.29
FBXO4-201ENST00000281623 PIK3C2GO75747 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
FBXO4-201ENST00000281623 ALKQ9UM73 1620 aa23.11■■□□□ 1.29
FBXO4-201ENST00000281623 TBX22Q9Y458 520 aa23.1■■□□□ 1.29
FBXO4-201ENST00000281623 NWD1Q149M9 1564 aa23.09■■□□□ 1.29
FBXO4-201ENST00000281623 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.07■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 PIK3R4Q99570 1358 aa23.07■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.07■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.06■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 CPS1P31327 1500 aa23.05■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 METP08581 1390 aa23.04■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 PTPRUQ92729 1446 aa23.03■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 ADGRB1O14514 1584 aa23.03■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
FBXO4-201ENST00000281623 TMF1P82094 1093 aa23.01■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 KCNA6P17658 529 aa23■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.99■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.98■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 CERKQ8TCT0 537 aa22.98■■□□□ 1.27
FBXO4-201ENST00000281623 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.94■■□□□ 1.26
FBXO4-201ENST00000281623 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.93■■□□□ 1.26
FBXO4-201ENST00000281623 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.92■■□□□ 1.26
FBXO4-201ENST00000281623 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FBXO4-201ENST00000281623 PTCH1Q13635 1447 aa22.9■■□□□ 1.26
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