RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264266.12

MFSD1-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD1, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-201ENST00000264266 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.93■■□□□ 1.9
MFSD1-201ENST00000264266 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.92■■□□□ 1.9
MFSD1-201ENST00000264266 IQGAP1P46940 1657 aa26.9■■□□□ 1.9
MFSD1-201ENST00000264266 LTKP29376 864 aa26.89■■□□□ 1.9
MFSD1-201ENST00000264266 KIF1BO60333 1816 aa26.89■■□□□ 1.9
MFSD1-201ENST00000264266 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 ZFYVE9O95405 1425 aa26.87■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.86■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.86■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.86■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.86■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 MED14O60244 1454 aa26.86■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 EID1Q9Y6B2 187 aa26.83■■□□□ 1.89
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
MFSD1-201ENST00000264266 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
MFSD1-201ENST00000264266 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.78■■□□□ 1.88
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
MFSD1-201ENST00000264266 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.73■■□□□ 1.87
MFSD1-201ENST00000264266 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.73■■□□□ 1.87
MFSD1-201ENST00000264266 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.72■■□□□ 1.87
MFSD1-201ENST00000264266 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.72■■□□□ 1.87
MFSD1-201ENST00000264266 PPLO60437 1756 aa26.71■■□□□ 1.87
MFSD1-201ENST00000264266 BCANQ96GW7 911 aa26.71■■□□□ 1.87
MFSD1-201ENST00000264266 RGL3Q3MIN7 710 aa26.7■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.7■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.68■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.68■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 IFT172Q9UG01 1749 aa26.67■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.64■■□□□ 1.86
MFSD1-201ENST00000264266 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.63■■□□□ 1.85
MFSD1-201ENST00000264266 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.63■■□□□ 1.85
MFSD1-201ENST00000264266 DIP2AQ14689 1571 aa26.6■■□□□ 1.85
MFSD1-201ENST00000264266 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
MFSD1-201ENST00000264266 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.58■■□□□ 1.85
MFSD1-201ENST00000264266 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.58■■□□□ 1.85
MFSD1-201ENST00000264266 CPS1P31327 1500 aa26.57■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 CERKQ8TCT0 537 aa26.56■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 NWD1Q149M9 1564 aa26.55■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.55■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.54■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 STAC3Q96MF2 364 aa26.54■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.52■■□□□ 1.84
MFSD1-201ENST00000264266 ALKQ9UM73 1620 aa26.51■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 TBX22Q9Y458 520 aa26.5■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 MYOM2P54296 1465 aa26.5■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.5■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 METP08581 1390 aa26.49■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 PIK3C2GO75747 1445 aa26.49■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 PTPRUQ92729 1446 aa26.49■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 KCNA6P17658 529 aa26.46■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
MFSD1-201ENST00000264266 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.45■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.44■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 PIK3R4Q99570 1358 aa26.42■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.42■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 USP47Q96K76 1375 aa26.41■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM94Q12767 1356 aa26.4■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.39■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.39■■□□□ 1.82
MFSD1-201ENST00000264266 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.38■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 LAMC1P11047 1609 aa26.38■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 MIER1Q8N108 512 aa26.37■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.34■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.33■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.33■■□□□ 1.81
MFSD1-201ENST00000264266 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.33■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 FBXO41Q8TF61 875 aa26.3■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.3■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.29■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 PTCH1Q13635 1447 aa26.29■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 STK26Q9P289 416 aa26.29■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC7Q96M83 1385 aa26.28■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 ADGRB1O14514 1584 aa26.28■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.27■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.27■■□□□ 1.8
MFSD1-201ENST00000264266 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
MFSD1-201ENST00000264266 C14orf37Q86TY3 774 aa26.26■■□□□ 1.79
MFSD1-201ENST00000264266 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
MFSD1-201ENST00000264266 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.24■■□□□ 1.79
MFSD1-201ENST00000264266 MSH6P52701 1360 aa26.23■■□□□ 1.79
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