RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049241.8

Hoxb4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxb4, Length 2,566 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pola1P33609 1465 aa23■■□□□ 1.27
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Myo5cE9Q1F5 1742 aa22.98■■□□□ 1.27
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa22.97■■□□□ 1.27
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 AnkarA2RT91 1465 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif16bB1AVY7 1312 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zfyve16Q80U44 1528 aa22.91■■□□□ 1.26
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Atf7ipQ7TT18 1306 aa22.84■■□□□ 1.25
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Bcl11aQ9QYE3 773 aa22.84■■□□□ 1.25
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Col17a1Q07563 1470 aa22.83■■□□□ 1.25
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Myo3aQ8K3H5 1613 aa22.82■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif7B7ZNG0 1348 aa22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Fan1Q69ZT1 1020 aa22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Usp40Q8BWR4 1235 aa22.8■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abca8aQ8K442 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arid3cA6PWV5 409 aa22.79■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Lemd3Q9WU40 921 aa22.79■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa22.78■■□□□ 1.24
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PtprtQ99M80 1454 aa22.77■■□□□ 1.23
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nphp4P59240 1425 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.73■■□□□ 1.23
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Stard8Q8K031 1019 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc27Q3V036 639 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Apbb1Q9QXJ1 710 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Neurod2Q62414 383 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 B4galnt3Q6L8S8 986 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ccdc30Q8BVF4 654 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Trpm1Q2TV84 1622 aa22.68■■□□□ 1.22
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Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cnga1P29974 684 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Talpid3E9PV87 1520 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa22.66■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa22.65■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Myom2Q14BI5 1463 aa22.64■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Golga2Q921M4 999 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Efcab6Q6P1E8 1516 aa22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Uggt1Q6P5E4 1551 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Dbr1Q923B1 550 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 OvosQ3UU35 1456 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gli2Q0VGT2 1544 aa22.59■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Depdc5P61460 1591 aa22.58■■□□□ 1.21
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Uspl1Q3ULM6 1089 aa22.57■■□□□ 1.2
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gas2l2Q5SSG4 860 aa22.57■■□□□ 1.2
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ptch1Q61115 1434 aa22.55■■□□□ 1.2
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Chmp5Q9D7S9 219 aa22.55■■□□□ 1.2
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 EspnQ9ET47 871 aa22.55■■□□□ 1.2
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 AU022751B1B0V2 589 aa22.55■■□□□ 1.2
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