RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025393.13

Smad4-201, Transcript of Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smad4, Length 3,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rwdd1Q9CQK7 243 aa26.35■■□□□ 1.81
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Atp10dQ8K2X1 1416 aa26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif3bQ61771 747 aa26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Stk24Q99KH8 431 aa26.33■■□□□ 1.81
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Trim26Q99PN3 545 aa26.29■■□□□ 1.8
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Tmf1B9EKI3 1091 aa26.19■■□□□ 1.78
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Smad4-201ENSMUST00000025393 AU015836B2RUM3 263 aa26.16■■□□□ 1.78
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Smad4-201ENSMUST00000025393 NhsB1AV60 1647 aa26.15■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cfap74Q3UY96 1578 aa26.14■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mast1Q9R1L5 1570 aa26.14■■□□□ 1.77
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Vsig10D3YX43 558 aa26.11■■□□□ 1.77
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.1■■□□□ 1.77
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Pank1Q8K4K6 548 aa26.08■■□□□ 1.77
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Smad4-201ENSMUST00000025393 ShprhQ7TPQ3 1674 aa26.04■■□□□ 1.76
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Abca8bQ8K440 1620 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kidins220E9Q9B7 1793 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ccdc183A2AJB1 534 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kcnn1Q9EQR3 537 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Abcc6Q9R1S7 1498 aa26.02■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa26.02■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ttc21bQ0HA38 1315 aa26.02■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa26.01■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Robo2Q7TPD3 1470 aa26.01■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cluap1Q8R3P7 413 aa26.01■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa26■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif7B7ZNG0 1348 aa25.99■■□□□ 1.75
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Ak9G3UYQ4 1894 aa25.96■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 ErbinQ80TH2 1402 aa25.96■■□□□ 1.75
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Smad4-201ENSMUST00000025393 PtprtQ99M80 1454 aa25.94■■□□□ 1.74
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Plch2A2AP18 1501 aa25.93■■□□□ 1.74
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Neurl4Q5NCX5 1563 aa25.93■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa25.92■■□□□ 1.74
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Gas2l2Q5SSG4 860 aa25.91■■□□□ 1.74
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tex14Q7M6U3 1450 aa25.89■■□□□ 1.73
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