RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid3cA6PWV5 409 aa34.89■■■■□ 3.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Esx1O88933 382 aa34.88■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uggt2E9Q4X2 1504 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfyve16Q80U44 1528 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam184bQ0KK56 942 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Egfem1Q8C088 590 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stk24Q99KH8 431 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nos1Q9Z0J4 1429 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm20521D3Z5F7 333 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pola1P33609 1465 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc21bQ0HA38 1315 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca9Q8K449 1623 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lemd3Q9WU40 921 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtprtQ99M80 1454 aa34.78■■■■□ 3.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ErbinQ80TH2 1402 aa34.77■■■■□ 3.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AnkarA2RT91 1465 aa34.76■■■■□ 3.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca6Q8K441 1624 aa34.76■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CrbnQ8C7D2 445 aa34.75■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fndc1E9Q043 1732 aa34.75■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa34.74■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NeflP08551 543 aa34.74■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fan1Q69ZT1 1020 aa34.72■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa34.72■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mink1Q9JM52 1308 aa34.72■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif16bB1AVY7 1312 aa34.71■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp40Q8BWR4 1235 aa34.69■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa34.69■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Iqgap3F8VQ29 1632 aa34.69■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa34.69■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ak9G3UYQ4 1894 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo3aQ8K3H5 1613 aa34.65■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif7B7ZNG0 1348 aa34.64■■■■□ 3.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AatkQ80YE4 1365 aa34.62■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca8aQ8K442 1620 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atf7ipQ7TT18 1306 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dcaf11Q91VU6 549 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col17a1Q07563 1470 aa34.58■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prex1Q69ZK0 1650 aa34.57■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rims1Q99NE5 1463 aa34.56■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stard8Q8K031 1019 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nlrp6Q91WS2 869 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa34.54■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nphp4P59240 1425 aa34.54■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TnikP83510 1323 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc41Q692V3 1318 aa34.51■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnga1P29974 684 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 OvosQ3UU35 1456 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ipo9Q91YE6 1041 aa34.47■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa34.45■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurod2Q62414 383 aa34.44■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rwdd1Q9CQK7 243 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp19Q3UJD6 1360 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhh1Q80TI1 1356 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gli2Q0VGT2 1544 aa34.42■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apbb1Q9QXJ1 710 aa34.41■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ptch1Q61115 1434 aa34.41■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpm1Q2TV84 1622 aa34.4■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myom2Q14BI5 1463 aa34.38■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc30Q8BVF4 654 aa34.37■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DnmbpQ6TXD4 1580 aa34.36■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll13A4Q9F6 804 aa34.36■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Talpid3E9PV87 1520 aa34.36■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efcab6Q6P1E8 1516 aa34.35■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Depdc5P61460 1591 aa34.35■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Golga2Q921M4 999 aa34.34■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AU022751B1B0V2 589 aa34.33■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stag3O70576 1240 aa34.33■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa34.33■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa34.32■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uggt1Q6P5E4 1551 aa34.32■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa34.32■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp10aO54827 1508 aa34.31■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B4galnt3Q6L8S8 986 aa34.31■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa34.27■■■■□ 3.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tecpr2Q3UH45 1423 aa34.24■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uspl1Q3ULM6 1089 aa34.22■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa34.21■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dbr1Q923B1 550 aa34.2■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akap12Q9WTQ5 1684 aa34.2■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gas2l2Q5SSG4 860 aa34.2■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PalldQ9ET54 1408 aa34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.5 ms