RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL17P36528 281 aa-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFH7P43591 353 aa-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNZ1Q03148 297 aa-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q BTS1Q12051 335 aa-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL229WQ99395 206 aa-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBP3P20447 523 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG22P25568 528 aa-0.05□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q DIG2Q03373 323 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR252CQ04814 134 aa-0.05□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDM35O60200 86 aa-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q POP4P38336 279 aa-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q URA8P38627 578 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER034WP40022 185 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q GVP36P40531 326 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q LPP1Q04396 274 aa-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD28Q12021 506 aa-0.06□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR156WP0CE96 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR159WP0CE97 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR161WP0CE98 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR285WP38354 144 aa-0.07□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q SED1Q01589 338 aa-0.07□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBF2P22204 572 aa-0.08□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q DOG2P38773 246 aa-0.08□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q VMA22P38784 181 aa-0.08□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q EAF6P47128 113 aa-0.08□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM9O74700 87 aa-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIR2P06700 562 aa-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAL80P26343 269 aa-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRB4P32569 687 aa-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRE6P40303 254 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q EMC2P47133 292 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCM22P47167 239 aa-0.09□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q POL30P15873 258 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM4P36156 370 aa-0.1□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL15P36523 253 aa-0.1□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q HPA3P39979 161 aa-0.1□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX20Q04935 205 aa-0.1□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC10P25342 322 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL102CP40488 101 aa-0.11□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR460CP54007 376 aa-0.11□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q SDO1Q07953 250 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR126CQ12288 251 aa-0.11□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q COA3Q3E7B2 85 aa-0.11□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBC8P28263 218 aa-0.12□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR149WP47177 404 aa-0.12□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR391CQ04170 232 aa-0.12□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCL042WP25572 119 aa-0.13□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q SKG1P36169 355 aa-0.13□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR203WQ08994 102 aa-0.13□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YRA1Q12159 226 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL008WP40001 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRM8P53174 237 aa-0.14□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRM3Q08931 133 aa-0.14□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCP1Q12106 302 aa-0.14□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSF1P08425 469 aa-0.15□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q OPI1P21957 404 aa-0.15□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC17P32602 292 aa-0.15□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL073CP40323 161 aa-0.15□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCW12Q12127 133 aa-0.15□□□□□ -2.43
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBC12P52491 188 aa-0.16□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAD4P69851 72 aa-0.16□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q BNA7Q04066 261 aa-0.16□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q URA5P13298 226 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPB7P34087 171 aa-0.17□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR242WP38331 238 aa-0.17□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q HOC1P47124 396 aa-0.17□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERV25P54837 211 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPT3P06844 337 aa-0.18□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q KRE28Q04431 385 aa-0.18□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR173WQ06247 608 aa-0.18□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q TDA8Q6B2U8 126 aa-0.18□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q BCY1P07278 416 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHL037CP38733 133 aa-0.19□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTT105P40063 208 aa-0.19□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.19□□□□□ -2.44not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q UPS3Q04006 179 aa-0.19□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q ODC2Q99297 307 aa-0.19□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q BET1P22804 142 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q AHT1P29589 182 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL37P36532 105 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUE1P38428 203 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM25P47140 327 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSA1P53136 463 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR274CP87283 123 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC123Q05791 360 aa-0.2□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPO13P23624 291 aa-0.21□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q TCA17P32613 152 aa-0.21□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAR064WP39563 99 aa-0.21□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR249CQ03787 373 aa-0.21□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q TCP1P12612 559 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAR7P43592 221 aa-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q DCV1P43595 202 aa-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR111CP47148 283 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM9P49957 279 aa-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q NUP84P52891 726 aa-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL50P53724 139 aa-0.22□□□□□ -2.44
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