RNA–Protein interactions for RNA: YOR367W

SCP1, Transcript of Component of yeast cortical actin cytoskeleton, yeast

Gene SCP1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCP1	YOR367W	COS8	P38723	381 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	IRC22	P40006	225 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RSM25	P40496	264 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	SBH2	P52871	88 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	FLC3	P53121	802 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	PLP1	Q04004	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	LPP1	Q04396	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	PEX11	Q12462	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	CUP2	P15315	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RCN1	P36054	211 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	FIS1	P40515	155 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	MRX8	Q05473	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	IES3	Q12345	250 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	CNB1	P25296	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	YAR068W	P39564	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	GLE2	P40066	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	COS6	P53344	381 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	HAL1	Q01766	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	SUE1	Q06524	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	BBP1	Q12365	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	RDI1	Q12434	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	SGA1	P08019	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	ATG22	P25568	528 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	AHC2	P25649	128 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	YFL012W	P43580	148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	MAK3	Q03503	176 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	AIM34	Q03673	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	GEP5	Q12393	293 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SCP1	YOR367W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	PCL1	P24867	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	POP4	P38336	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YDC1	Q02896	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	GAS3	Q03655	524 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	DYN3	Q04949	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	SPC2	Q04969	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	SHH4	Q06236	168 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	SKG1	P36169	355 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	POP7	P38291	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	SOK1	P40317	901 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YFR045W	P43617	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MIG2	P53035	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	HST4	P53688	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	TSA2	Q04120	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	PIN3	Q06449	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	SCO1	P23833	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	OST2	P46964	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MOG1	P47123	218 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MHT1	Q12525	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	SEC17	P32602	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	TVP38	P36164	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MRPS9	P38120	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	ATG39	Q06159	398 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
SCP1	YOR367W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	RSM10	Q03201	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	GPI17	Q04080	534 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	BET1	P22804	142 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	MED6	P38782	295 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	ICE2	P40499	491 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
SCP1	YOR367W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SCP1	YOR367W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCP1	YOR367W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCP1	YOR367W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCP1	YOR367W	PET54	P10834	293 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SCP1	YOR367W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SCP1	YOR367W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77

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