RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	FZO1	P38297	855 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	WSS1	P38838	269 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	MST28	P39552	234 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YGR201C	P42936	225 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YFR035C	P43608	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	ERG25	P53045	309 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	MST27	P53176	234 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	PGA1	P53896	198 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	ARR2	Q06597	130 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	NDE2	Q07500	545 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	SAG1	P20840	650 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	UBC8	P28263	218 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	IMP1	P28627	190 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	LTV1	P34078	463 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	GAT4	P40569	121 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	ECM27	P47144	725 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	DYN3	Q04949	312 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YDL199C	Q12407	687 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RIB3	Q99258	208 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
TTI1	YKL033W	CPR5	P35176	225 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	FRM2	P37261	193 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RIB5	P38145	238 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YNL033W	P53964	284 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YNL019C	P53975	284 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	ODC1	Q03028	310 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YMR102C	Q03177	834 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	HSP31	Q04432	237 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	NFI1	Q12216	726 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	HUT1	Q12520	339 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
TTI1	YKL033W	MSW1	P04803	379 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	IST2	P38250	946 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	MAM33	P40513	266 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	STB1	P42845	420 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	SOL1	P50278	321 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YGL114W	P53134	725 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	TOS8	P53147	276 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YGR219W	P53307	113 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YDR239C	Q03780	787 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YHP1	Q04116	353 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	PEX12	Q04370	399 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	GPI11	Q06636	219 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	VAM3	Q12241	283 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	BBP1	Q12365	385 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	PRM4	Q12498	284 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TTI1	YKL033W	QCR7	P00128	127 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TRP1	P00912	224 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CUP2	P15315	225 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	POP2	P39008	433 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TRS85	P46944	698 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FMP48	P53233	369 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SPG4	Q04438	115 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NCA2	Q12374	616 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ISA2	Q12425	185 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	COX9	P07255	59 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NUF2	P33895	451 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YKR045C	P36138	183 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MIC12	P38341	106 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MBB1	P39534	108 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AVT6	P40074	448 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGL101W	P53144	215 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRH4	P53166	561 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PRM8	P53174	237 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RSM27	P53305	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SPR6	Q01684	191 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRX8	Q05473	314 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NSL1	Q12143	216 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPT6	Q99260	215 aa		0.9	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATP10	P18496	279 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPS1	P32329	569 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ZRT3	P34240	503 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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