RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	ASM4	Q05166	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SYM1	Q06563	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ATG5	Q12380	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ODC2	Q99297	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RIP1	P08067	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ATG15	P25641	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	FMT1	P32785	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YKL075C	P36083	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	CHK1	P38147	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	CUE1	P38428	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SKN7	P38889	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YEA4	P40004	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	IKS1	P47042	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	TRM9	P49957	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YNR066C	P53752	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	STD1	Q02794	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	IZH2	Q12442	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	LSB5	P25369	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	HSP10	P38910	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YEA6	P39953	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	IRC24	P40580	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	UBP8	P50102	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YGL235W	P53071	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	CAB5	Q03941	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	VAM3	Q12241	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YOP1	Q12402	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	NPC2	Q12408	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	COX5B	P00425	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	DAL80	P26343	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	TIM12	P32830	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	MDL1	P33310	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SLM6	P38343	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SPG5	P42933	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YGR149W	P48236	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ASK10	P48361	1146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	NRM1	P53718	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	BUD25	P85052	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YDR366C	P87287	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	NCE101	Q02820	53 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YML018C	Q03730	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SHH3	Q04487	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SRL2	Q12020	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ORT1	Q12375	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SPO7	P18410	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	MAK32	P23060	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	MRPL16	P38064	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	PEX7	P39108	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	BNA2	P47125	453 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YGR151C	P53287	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YAP1802	P53309	568 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	MRPL19	P53875	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	SNO4	Q04902	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	HSP32	Q08992	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	REX3	Q12090	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	YCT1	Q12235	531 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDI1	YCL043C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	QCR2	P07257	368 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	SLC1	P33333	303 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	PMU1	P36069	295 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	RPP1	P38786	293 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	YHR210C	P38893	341 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	POP2	P39008	433 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	ATG27	P46989	271 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	GWT1	P47026	490 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	ABM1	P47146	123 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	BXI1	P48558	297 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	EKI1	Q03764	534 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	THI74	Q04083	370 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	PAU23	Q07987	124 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	PAU17	Q12370	124 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PDI1	YCL043C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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