RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SPT14	P32363	452 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MRPS5	P33759	307 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YCR041W	P37265	110 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YBR096W	P38256	230 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YER084W	P40057	128 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	DLS1	P40366	167 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	BNA6	P43619	295 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CIN2	P46670	268 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	LOH1	P47055	219 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ERV29	P53337	310 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	AAH1	P53909	347 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RCE1	Q03530	315 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HEM25	Q07534	307 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ORT1	Q12375	292 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	IZH2	Q12442	317 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SGA1	P08019	549 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	NAM2	P11325	894 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	KRE6	P32486	720 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MNS1	P32906	549 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RCN1	P36054	211 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SEN34	P39707	275 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HXT14	P42833	540 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MOB2	P43563	287 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YJL055W	P47044	245 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	IRC18	P47056	224 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YJL016W	P47072	561 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	NRK1	P53915	240 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	API2	Q04413	109 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PEX30	Q06169	523 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ISA2	Q12425	185 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.46	□□□□□ -1.86	not detected
SLX1	YBR228W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CAP2	P13517	287 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	AFG1	P32317	509 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	ERG3	P32353	365 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SNC2	P33328	115 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CLG1	P35190	452 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YHL037C	P38733	133 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HPA3	P39979	161 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YFL051C	P43552	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	PHB2	P50085	310 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SIP18	P50263	79 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	FMP48	P53233	369 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HHT1	P61830	136 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	BUD25	P85052	153 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	FIT3	Q08907	204 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	PET18	P25362	215 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	AVT7	P40501	490 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SYS1	P41544	203 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	TPN1	P53099	579 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YGL159W	P53110	370 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	VHT1	P53241	593 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YNR048W	P53740	393 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RNH201	P53942	307 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CTF19	Q02732	369 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YDR391C	Q04170	232 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	PEX10	Q05568	337 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	KEI1	Q06346	221 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HXT2	P23585	541 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HYM1	P32464	399 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CLB6	P32943	380 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	UMP1	P38293	148 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YHR122W	P38829	231 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	MST28	P39552	234 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	FLX1	P40464	311 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YKE4	P40544	346 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CAT5	P41735	233 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SSN8	P47821	323 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	BXI1	P48558	297 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YIP5	P53108	310 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YGR042W	P53227	271 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YKR005C	Q02203	525 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YLR283W	Q05867	314 aa		3.44	□□□□□ -1.86

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