RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0144Q0144 RAD28Q12021 506 aa-0.58□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 YLR156WP0CE96 114 aa-0.59□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 YLR159WP0CE97 114 aa-0.59□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 YLR161WP0CE98 114 aa-0.59□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 PRE6P40303 254 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 DBF2P22204 572 aa-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 PRX1P34227 261 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 MRPL28P36527 147 aa-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 VMA22P38784 181 aa-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 YAR1P46683 200 aa-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 YML108WQ03759 105 aa-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 LPP1Q04396 274 aa-0.6□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 GVP36P40531 326 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 EGD1Q02642 157 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 COX20Q04935 205 aa-0.61□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 MDM35O60200 86 aa-0.62□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 DBP3P20447 523 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 YKL075CP36083 450 aa-0.62□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 POP4P38336 279 aa-0.62□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 CSM4Q08955 156 aa-0.62□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 RPL24AP04449 155 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 DOG2P38773 246 aa-0.64□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 YLR460CP54007 376 aa-0.64□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 BTS1Q12051 335 aa-0.64□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 TIM9O74700 87 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 CDC10P25342 322 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 RPT5P33297 434 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 YEL008WP40001 126 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 YLR126CQ12288 251 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0144Q0144 KRR1P25586 316 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 YBR285WP38354 144 aa-0.67□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 YRA1Q12159 226 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 COA3Q3E7B2 85 aa-0.68□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 YER034WP40022 185 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 POL30P15873 258 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 EMC2P47133 292 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 SRB4P32569 687 aa-0.71□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 YIL102CP40488 101 aa-0.71□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 PET100P38958 111 aa-0.72□□□□□ -2.52
Q0144Q0144 MRPL15P36523 253 aa-0.73□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 SDO1Q07953 250 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 HPA3P39979 161 aa-0.74□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 YPL073CP40323 161 aa-0.74□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 DAL80P26343 269 aa-0.75□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 YDR391CQ04170 232 aa-0.75□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 YJR149WP47177 404 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 MCM22P47167 239 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 SKG1P36169 355 aa-0.78□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 YPR203WQ08994 102 aa-0.78□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 MCP1Q12106 302 aa-0.78□□□□□ -2.53
Q0144Q0144 OPI1P21957 404 aa-0.79□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 CCW12Q12127 133 aa-0.8□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 UBC8P28263 218 aa-0.81□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 MSF1P08425 469 aa-0.82□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 ECM4P36156 370 aa-0.82□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 TDA8Q6B2U8 126 aa-0.82□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 TCP1P12612 559 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 SEC17P32602 292 aa-0.84□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 RPB7P34087 171 aa-0.84□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 YHL037CP38733 133 aa-0.84□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 PRM8P53174 237 aa-0.84□□□□□ -2.54
Q0144Q0144 YDR274CP87283 123 aa-0.85□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 MRPL37P36532 105 aa-0.86□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 DRS2P39524 1355 aa-0.86□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 AHT1P29589 182 aa-0.87□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 HOC1P47124 396 aa-0.87□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 UPS3Q04006 179 aa-0.87□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 BNA7Q04066 261 aa-0.87□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 FAS1P07149 2051 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 YAR064WP39563 99 aa-0.88□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 NSA1P53136 463 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 PRM3Q08931 133 aa-0.88□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 YFL051CP43552 160 aa-0.89□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 TRM9P49957 279 aa-0.89□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
Q0144Q0144 LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.9□□□□□ -2.55not detected
Q0144Q0144 UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 YBR242WP38331 238 aa-0.91□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 TVP23P38962 199 aa-0.91□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 DAD4P69851 72 aa-0.91□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 ODC2Q99297 307 aa-0.91□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 URA5P13298 226 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 ERV25P54837 211 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 SPO13P23624 291 aa-0.93□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 NUP84P52891 726 aa-0.93□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 BCY1P07278 416 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 RTT105P40063 208 aa-0.94□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 BET1P22804 142 aa-0.95□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 MET31Q03081 177 aa-0.96□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 CDC123Q05791 360 aa-0.96□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 MGM101P32787 269 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 CUE1P38428 203 aa-0.97□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 FIT2Q08906 153 aa-0.97□□□□□ -2.56
Q0144Q0144 MPC3P53311 146 aa-0.98□□□□□ -2.57
Q0144Q0144 YDR249CQ03787 373 aa-0.98□□□□□ -2.57
Q0144Q0144 PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.2 ms