RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PSPNO60542 156 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RHOBTB3O94955 611 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 IL18RAPO95256 599 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MED26O95402 600 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PYGLP06737 847 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KITP10721 976 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFAIP3P21580 790 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGS1P23219 599 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CASP2P42575 452 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NUCB1Q02818 461 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNMA1Q12791 1236 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PMS2P11Q13670 270 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DAG1Q14118 895 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PLS1Q14651 629 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPT2Q15019 361 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CNGA2Q16280 664 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CD276Q5ZPR3 534 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TMC6Q7Z403 805 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRX1Q86UT6 975 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SESTD1Q86VW0 696 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF527Q8NB42 609 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf20Q8ND61 904 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CALML6Q8TD86 181 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35A4Q96G79 324 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF287Q9HBT7 754 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP10DQ9P241 1426 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 COL18A1P39060 1754 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 AK9Q5TCS8 1911 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA3Q99758 1704 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GVC2 190 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPL8 197 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ISM1B1AKI9 464 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 J3KRW8 73 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.632e-10■□□□□ 10.5
CAPNS1-210ENST00000590211 APOL1O14791 398 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FFAR2O15552 330 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SRGAP3O43295 1099 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SGTAO43765 313 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DYRK3O43781 588 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PROCP04070 461 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PRNPP04156 253 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 THP07101 528 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DBHP09172 617 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA7P48741 367 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVFC1P60507 584 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP4F8P98187 520 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RASSF7Q02833 373 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRNEQ04844 493 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZP2Q05996 745 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STARD3Q14849 445 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT24Q2M2I5 525 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MPEG1Q2M385 716 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HYIQ5T013 277 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.84□□□□□ -1.63
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