RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GUCD1Q96NT3 240 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GBP4Q96PP9 640 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACSS2Q9NR19 701 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 OXSMQ9NWU1 459 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CROTQ9UKG9 612 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZHX2Q9Y6X8 837 aa10.38□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPTORQ8N122 1335 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENTPD3O75355 529 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF28P17035 718 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 RGS3P49796 1198 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCNN1BP51168 640 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF174Q15697 407 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF19Q5T6S3 580 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2W6PQ8NHA6 318 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIB2Q92519 343 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GJD2Q9UKL4 321 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASB1Q9Y576 335 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAMTS20P59510 1910 aa10.37□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPIG6BO95866 241 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHGBP05060 677 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYN1P17600 705 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 MC4RP32245 332 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLRBP48167 497 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 FNTBP49356 437 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GADL1Q6ZQY3 521 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 LPIN2Q92539 896 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 COA7Q96BR5 231 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 INCENPQ9NQS7 918 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCND1Q9NSA2 647 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.36□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM75PA6NK02 468 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL18BPO95998 194 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP17A1P05093 508 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLURP1P55000 103 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR63Q8IWG1 891 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GALNT8Q9NY28 637 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.35□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLGA6L22H0YM25 854 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 EYA2O00167 538 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO21O94952 628 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC5A1P13866 664 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX5P35711 763 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHCR24Q15392 516 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 STPG3Q8N7X2 389 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIPK4Q8NE63 616 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP40Q9NVE5 1235 aa10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 REV3LO60673 3130 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 PARP14Q460N5 1801 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM13O60858 407 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC9A1P19634 815 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHBDL3P58872 404 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFHBQ8N7U6 833 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBR7Q8N806 425 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF384Q8TF68 577 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 C16orf92Q96LL3 132 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA25Q9BR10 227 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMNQ9BXJ7 453 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.33□□□□□ -0.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms