RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MPST	P25325	297 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CTNNB1	P35222	781 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	GRIA4	P48058	902 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RCAN1	P53805	252 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	EVC	P57679	992 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RING1	Q06587	406 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	IKZF1	Q13422	519 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ADAM15	Q13444	863 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MTMR1	Q13613	665 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	NEDD9	Q14511	834 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RABEP1	Q15276	862 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	DGKD	Q16760	1214 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PRR16	Q569H4	304 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	FYB2	Q5VWT5	728 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	FBXL16	Q8N461	479 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MORC4	Q8TE76	937 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	GLG1	Q92896	1179 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	APOL5	Q9BWW9	433 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	BACH2	Q9BYV9	841 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MAF1	Q9H063	256 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	USP18	Q9UMW8	372 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994		Q9Y3F1	56 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIP11	Q15643	1979 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BQV1	296 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	FIBP	O43427	364 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	NBN	O60934	754 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP9A	O75110	1047 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PPFIA4	O75335	1185 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	STAM2	O75886	525 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CTDNEP1	O95476	244 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	GLP2R	O95838	553 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MMP3	P08254	477 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	EDNRB	P24530	442 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MARK3	P27448	753 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	KRT2	P35908	639 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CLCN5	P51795	746 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	OXCT1	P55809	520 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	IGBP1	P78318	339 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP4	P98171	946 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP1	Q07960	439 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	AP3B2	Q13367	1082 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	MTMR3	Q13615	1198 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PTGIS	Q16647	500 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	INF2	Q27J81	1249 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	LETM2	Q2VYF4	491 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	TBCK	Q8TEA7	893 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CDHR1	Q96JP9	859 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	C8orf76	Q96K31	380 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	YME1L1	Q96TA2	773 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	KIF2C	Q99661	725 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	CDH22	Q9UJ99	828 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-231	ENST00000554994	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57

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