RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TEKT4Q8WW24 435 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 C18orf8Q96DM3 657 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 BTBD19C9JJ37 291 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 E5RI56 91 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 INSRRP14616 1297 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ADCY1Q08828 1119 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NFIAQ12857 509 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TBCCQ15814 346 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 P3H1Q32P28 736 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PDIK1LQ8N165 341 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM143Q96AN5 459 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ITM2BQ9Y287 266 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF536O15090 1300 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POTECB2RU33 542 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NCOA4Q13772 614 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 UGP2Q16851 508 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 KIZQ2M2Z5 673 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CALML6Q8TD86 181 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HPDLQ96IR7 371 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TMX1Q9H3N1 280 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DPP3Q9NY33 737 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PXDNQ92626 1479 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SHPRHQ149N8 1683 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SNAP23O00161 211 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ADH1CP00326 375 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RWDD2BP57060 319 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEP78395 509 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PTK7Q13308 1070 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 IRF5Q13568 498 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 LONRF3Q496Y0 759 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RMDN1Q96DB5 314 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 VCXQ9H320 206 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 USP20Q9Y2K6 914 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 INSL6Q9Y581 213 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SGK1O00141 431 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RPN2P04844 631 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SLC1A1P43005 524 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TERF1P54274 439 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 GRIK3Q13003 919 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 IL31Q6EBC2 164 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PARVAQ9NVD7 372 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 VPS51Q9UID3 782 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MTMR6Q9Y217 621 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NFATC1O95644 943 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ALPPL2P10696 532 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HPS3Q969F9 1004 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ULK4Q96C45 1275 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CLUHO75153 1309 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 C2CD2LO14523 706 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CLGNO14967 610 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 LGALS2P05162 132 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CAV1Q03135 178 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CCNG2Q16589 344 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 Q4G0T1 1027 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SNX19Q92543 992 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ACDQ96AP0 544 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CYB561D2O14569 222 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PPFIA2O75334 1257 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 LGR5O75473 907 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 GNSP15586 552 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 GLUD2P49448 558 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms