RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 FAM84AQ96KN4 292 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 SUSD3Q96L08 255 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 TMEM206Q9H813 350 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 MTRRQ9UBK8 725 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 MUTYHQ9UIF7 546 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 HPSEQ9Y251 543 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 CDY1Q9Y6F8 540 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 ANK1P16157 1881 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 GARTP22102 1010 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 NUCB2P80303 420 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 EHHADHQ08426 723 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 RAB33AQ14088 237 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 EFCAB13Q8IY85 973 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 BEST2Q8NFU1 509 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 ASB7Q9H672 318 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 C2orf16Q68DN1 1984 aa13.02□□□□□ -0.32
NISCH-214ENST00000490425 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PQ27 194 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PQ64 194 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PQD8 194 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SYN3O14994 580 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KLRC4O43908 158 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 EXTL3O43909 919 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 IL18RAPO95256 599 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C1RP00736 705 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ARPP19P56211 112 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 HDAC7Q8WUI4 952 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DPP3Q9NY33 737 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DPP7Q9UHL4 492 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 USP25Q9UHP3 1055 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DERAQ9Y315 318 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C2CD2Q9Y426 696 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 BACE2Q9Y5Z0 518 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CLIC2O15247 247 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SPTLC1O15269 473 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TGFB1I1O43294 461 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DCXO43602 365 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D4O60343 1298 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZMYND10O75800 440 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C8AP07357 584 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PRR29P0C7W0 189 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 LILRA4P59901 499 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ROR1Q01973 937 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 LIN9Q5TKA1 542 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GPD1LQ8N335 351 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 APPL2Q8NEU8 664 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PIDD1Q9HB75 910 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 EXOC1Q9NV70 894 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 FBXL5Q9UKA1 691 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 NR2E1Q9Y466 385 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SCN1AP35498 2009 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 UBE4BO95155 1302 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ANO9A1A5B4 782 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 WDR27A2RRH5 827 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 H7C4K7 107 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 M0QZQ0 153 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PIRO00625 290 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CCL16O15467 120 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ALADP13716 330 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CYP2J2P51589 502 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 STK4Q13043 487 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms