RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MTA3Q9BTC8 594 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NAGPAQ9UK23 515 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 V9GYQ6 96 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MYBL2P10244 700 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ITGA4P13612 1032 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CIITAP33076 1130 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 GJB7Q6PEY0 223 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PADI6Q6TGC4 694 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TMC3Q7Z5M5 1100 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NRBP2Q9NSY0 501 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HMOX2P30519 316 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CDH6P55285 790 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 KCNA1Q09470 495 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CCDC80Q76M96 950 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 KLHL23Q8NBE8 558 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TTC8Q8TAM2 541 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 GDPD5Q8WTR4 605 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ATG4AQ8WYN0 398 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MTMR8Q96EF0 704 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PARVBQ9HBI1 364 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PEX5P50542 639 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HORMAD1Q86X24 394 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 RCOR2Q8IZ40 523 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PARVAQ9NVD7 372 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 BFARQ9NZS9 450 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ATP7BP35670 1465 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PALLDQ8WX93 1383 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ZNF839A8K0R7 811 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FMO5P49326 533 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 DMC1Q14565 340 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CCDC17Q96LX7 622 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FAM196BA6NMK8 535 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 KCNN4O15554 427 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 LGR5O75473 907 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PAMP19021 973 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FNTAP49354 379 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 AQP5P55064 265 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 GRM4Q14833 912 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 THAP2Q9H0W7 228 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TBX22Q9Y458 520 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ALBP02768 609 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ETS2P15036 469 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 HADHAP40939 763 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 INAQ16352 499 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CREG2Q8IUH2 290 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 GDF3Q9NR23 364 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LAMC1P11047 1609 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D12O60347 775 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 GDF11O95390 407 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MROH9Q5TGP6 573 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K14Q99558 947 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZSWIM1Q9BR11 485 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 BTG4Q9NY30 223 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CDYLQ9Y232 598 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 XDHP47989 1333 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 RALAP11233 206 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 C21orf59P57076 290 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ACTR2P61160 394 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138 ms